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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000440`

染色体: Chr03 坐标: 4739170-4739943 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000440`
名称	SmilChr03G000440
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4739170 - 4739943 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018168`
GeneID	`131018168`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018168`
原始查询	`LOC131018168`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
Arabidopsis	`AT3G06240` (AT3G06240) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819798] identity=26.7; qcov=1.08; evalue=1.2e-15; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03478 (Beta-prop_KIB1-4); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018168

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802869.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057802869.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802869.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802869.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802869.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4739204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr3:4739245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr3:4739260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr3:4739262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B23,C39
`Chr3:4739269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C14
`Chr3:4739361`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	33	A11,A7,B10,B101,B107,B127,B137,B18,B37,B51,B53,B59,B71,B79,B84,B90,B92,C1,C12,C15,C19,C29,C46,C48,C54,C61,C63,C69,C78,C83,C87,D5,D9
`Chr3:4739364`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	41	A11,A7,B10,B101,B107,B127,B128,B134,B137,B18,B35,B37,B51,B53,B59,B71,B79,B84,B90,B92,C1,C12,C15,C19,C20,C26,C29,C38,C46,C48,C50,C54,C61,C63,C69,C78,C79,C83,C87,D5,D9
`Chr3:4739487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:4739510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B23,C39
`Chr3:4739513`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C78
`Chr3:4739521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:4739556`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802869.1

257 aa

128

257

FBA_3

Beta-prop_KIB1-4

FBA_1

PF08268 FBA_3 7-191 aa PF03478 Beta-prop_KIB1-4 8-195 aa PF07734 FBA_1 12-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802869.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	7	191	7.2e-13	49.0	F-box associated beta propeller domain
`XP_057802869.1`	Pfam	`PF03478`	Beta-prop_KIB1-4	Repeat	8	195	5.6e-07	30.0	KIB1-4 beta-propeller
`XP_057802869.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	12	216	7.9e-19	68.5	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946886.1
ATGGCGACATTGCTACCATATCAAATTTTGGGATGCTGTAATGGGCTGTTCTGCGTTCTCAAGAAGTCAAGAAAACGTGCAGAAATTTTTCAAGAAATTTACTTGTGGAACCCATCGACTCGGACCTCCAAGAAACTGCCAGAAATTTCCAGTCCCGGCTATGTTCGTAATTACGGGTTCGGTTGGGTTGAATCGAGTGATGAGTACAAGGTGTTTGTGCTTTTGTTTCATTGTGATTATTACCGAGGGATTGATAACTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018168
ATGGCGACATTGCTACCATATCAAATTTTGGGATGCTGTAATGGGCTGTTCTGCGTTCTCAAGAAGTCAAGAAAACGTGCAGAAATTTTTCAAGAAATTTACTTGTGGAACCCATCGACTCGGACCTCCAAGAAACTGCCAGAAATTTCCAGTCCCGGCTATGTTCGTAATTACGGGTTCGGTTGGGTTGAATCGAGTGATGAGTACAAGGTGTTTGTGCTTTTGTTTCATTGTGATTATTACCGAGGGATTGATAACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802869.1
MATLLPYQILGCCNGLFCVLKKSRKRAEIFQEIYLWNPSTRTSKKLPEISSPGYVRNYGFGWVESSDEYKVFVLLFHCDYYRGIDNWVGKVYSSKTKSWKTIELSGYLRVSWARGVFAGGKLYWKNYGDKEGITFWDLKSEVFGRIELPFDQEVYGIVGVLGGFLCVLCFNDQITGIRGVPVWVMKESWEKVVTLSHLLELLQPPLVKGLNGDILVNCGSTVVVYDCRDNVFCNLEYRSFSLSCHVCVESLVSPKDL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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