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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000469`

染色体: Chr03 坐标: 5007391-5013329 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000469`
名称	SmilChr03G000469
描述	probable disease resistance protein At1g58390
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5007391 - 5013329 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018176`
GeneID	`131018176`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018176`
原始查询	`LOC131018176`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein At1g58390
产物	probable disease resistance protein At1g58390
Arabidopsis	`AT1G58390` (AT1G58390) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842208] identity=35.9; qcov=0.493; evalue=6.83e-28; confidence=medium
Rice	`Os10g0162846` - identity=28.2; qcov=0.566; evalue=2.02e-24; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018176

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057802879.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802879.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057802879.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802879.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802879.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5007538`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	82	A13,A2,A24,A4,A5,B10,B100,B104,B105,B113,B117,B12,B120,B124,B126,B127,B13,B132,B137,B14,B140,B15,B16,B17,B2,B24,B25,B29,B3,B31,B34,B38,B39,B42,B43,B45,B5,B52,B55,B56,B59,B63,B65,B67,B68,B70,B76,B79,B91,B96,B97,C13,C14,C15,C19,C21,C32,C35,C40,C42,C55,C56,C6,C62,C65,C68,C71,C73,C74,C75,C82,C86,C9,D1,D11,D2,D3,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr3:5007582`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	49	A15,A2,A22,B102,B105,B118,B12,B122,B125,B13,B131,B132,B136,B139,B14,B21,B28,B3,B4,B41,B42,B43,B46,B47,B52,B56,B62,B71,B94,C12,C13,C23,C37,C4,C45,C46,C53,C56,C59,C61,C62,C64,C65,C70,C72,C75,C82,C86,D3
`Chr3:5007672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A10,B100,B114
`Chr3:5007672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B100,B114
`Chr3:5007700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:5007772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B60,C30,C8
`Chr3:5007798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B44,B85,D6
`Chr3:5007810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B60,C8
`Chr3:5007814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B74,C14
`Chr3:5007818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B93
`Chr3:5007822`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B40,B44,B54,B85,B86,D6
`Chr3:5007858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802879.1

576 aa

288

576

NB-ARC

LRR_14

LRR_8

PF00931 NB-ARC 59-156 aa PF23598 LRR_14 281-530 aa PF13855 LRR_8 287-341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802879.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	59	156	2.2e-12	47.6	NB-ARC domain
`XP_057802879.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	281	530	2.1e-30	106.4	Leucine-rich repeat region
`XP_057802879.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	287	341	4.6e-09	36.6	Leucine rich repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946896.1
ATGGGAGCTCTTATGGCTTTGGTTGTACAGTGGTGGAGGTTATGGCAGGAGGTGGAAACGTTCAAGCCGAAGCTTACCTTGAGGATTTGGCGGAAGTTGGGCAGCTCTTTCTCTCCTGTTAATGAAGTCTCAAATGAACTGAAGCTTGTTCAAGTAGTTGATAGTGAGGAAATGGAAAGAGATTCGTTATTGGAAAAGATGGAGCACGCAGACAACCCAAGTCTCCGAGAAATGCTTCACCAATACCTACAAGGAAGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018176
ATGGGAGCTCTTATGGCTTTGGTTGTACAGTGGTGGAGGTTATGGCAGGAGGTGGAAACGTTCAAGCCGAAGCTTACCTTGAGGATTTGGCGGAAGTTGGGCAGCTCTTTCTCTCCTGTTAATGAAGTCTCAAATGAACTGAAGCTTGTTCAAGTAGTTGATAGTGAGGAAATGGAAAGAGATTCGTTATTGGAAAAGATGGAGCACGCAGACAACCCAAGTCTCCGAGAAATGCTTCACCAATACCTACAAGGAAGGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802879.1
MGALMALVVQWWRLWQEVETFKPKLTLRIWRKLGSSFSPVNEVSNELKLVQVVDSEEMERDSLLEKMEHADNPSLREMLHQYLQGRQYLIVLDDLPKRIRLQSILGALPYEDKKSRLVFTSHTTSANVRIMDHEVYDMEFLDSKKSWKLFLQTINRGNKLGGEYNFPKELEKQGREMLTKYCCGLPLAIKEVGKQLAKKRCLGSEWEELLQQPIDLGTTLEKLDPFYHKLDEEVKPCFLQMAFYKENITMREEKMEQIWS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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