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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000477`

染色体: Chr03 坐标: 5064634-5077961 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000477`
名称	SmilChr03G000477
描述	probable disease resistance protein At1g59620
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5064634 - 5077961 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018178`
GeneID	`131018178`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018178`
原始查询	`LOC131018178`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein At1g59620
产物	probable disease resistance protein At1g59620
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=34.9; qcov=0.701; evalue=1.19e-49; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=29.8; qcov=0.716; evalue=4.02e-38; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0050832 (defense response to fungus)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018178

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802881.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802881.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802881.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802881.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802881.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5064687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr3:5064695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,B53,C56,C77
`Chr3:5064746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C60
`Chr3:5064751`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B72
`Chr3:5064751`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B72
`Chr3:5064767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B95,B96,C83
`Chr3:5064768`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B66,B72
`Chr3:5064768`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B66,B72
`Chr3:5064772`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B66,B72,C56,C75
`Chr3:5064772`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B66,B72,C56,C75
`Chr3:5064784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B132,B19,B66,C39
`Chr3:5064803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B47,B95,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802881.1

539 aa

270

539

Rx_N

NB-ARC

LRR_14

PF18052 Rx_N 6-89 aa PF00931 NB-ARC 177-343 aa PF23598 LRR_14 371-520 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802881.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	6	89	6e-23	81.5	Rx N-terminal domain
`XP_057802881.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	177	343	1.9e-35	122.7	NB-ARC domain
`XP_057802881.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	371	520	7.3e-14	52.0	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946898.1
AGCAATTTTGTCATCGATCATTATGGCAGCTGAAGCGGCAATCTCATCTGTGGTCGAACTACTGGGCAATCAGTTGATTCAGAAGGTTAAATCCCTGCAAGGCGTCGAGGGAAAGGTGGAGTTGCTGAGAGAGGAGCTGAAGAGGATGCAATCCTTTCTCAAAGACGCCAACAAAAAGCAATTTGAAGACGAGAGCGTGCGTAATTGGATCTCGAATATCAGAGAGTTGGCTCAAGATGCCCAAGATACCATCGAGATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018178
ATGGCAGCTGAAGCGGCAATCTCATCTGTGGTCGAACTACTGGGCAATCAGTTGATTCAGAAGGTTAAATCCCTGCAAGGCGTCGAGGGAAAGGTGGAGTTGCTGAGAGAGGAGCTGAAGAGGATGCAATCCTTTCTCAAAGACGCCAACAAAAAGCAATTTGAAGACGAGAGCGTGCGTAATTGGATCTCGAATATCAGAGAGTTGGCTCAAGATGCCCAAGATACCATCGAGATCTTCCTTCTCAACGTTGAGAGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802881.1
MAAEAAISSVVELLGNQLIQKVKSLQGVEGKVELLREELKRMQSFLKDANKKQFEDESVRNWISNIRELAQDAQDTIEIFLLNVESAKNGGLIKRCTTFPKRMHHLDKIGDEIESIQARLDAIDKSRERYGIKDLGEAAESASRWQIEMRRRLCPWQKNEHLVGVEDDLKKLLQESILHEKKGLCIAVLEGMGGIGKSTLAREIYNHPDVVAGPFERRGWVVVSSEFTPQETIKQLIFDLPGSDKQKVRELEETMKDNRY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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