当前解析结果
SmilChr03G000528| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000528 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000528 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000528 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 5651875 - 5653283 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018196 |
|---|---|
| GeneID | 131018196 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018196 |
| 原始查询 | LOC131018196 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018196 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057802903.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057802903.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 1.00000 | XP_057802903.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057802903.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057802903.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:5651922 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | A22,C31,C63,C67 |
Chr3:5651922 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | A22,C31,C63,C67 |
Chr3:5651931 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B24,B83,C5,C79 |
Chr3:5651933 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B122,B131,B50,B53,B94 |
Chr3:5651953 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A5,B77 |
Chr3:5651955 |
ACT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B19 |
Chr3:5651955 |
ACT |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B19 |
Chr3:5651963 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D5 |
Chr3:5651965 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B118,C1,C21,C26 |
Chr3:5652005 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,B31 |
Chr3:5652006 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,B115,C45,C78 |
Chr3:5652094 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | B122,B53,B88,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。