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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000558`

染色体: Chr03 坐标: 6056044-6087403 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000558`
名称	SmilChr03G000558
描述	sclareol synthase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	6056044 - 6087403 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018203`
GeneID	`131018203`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018203`
原始查询	`LOC131018203`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sclareol synthase, chloroplastic-like
产物	sclareol synthase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G79460` (GA2) Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844284] identity=32.8; qcov=0.869; evalue=8.99e-78; confidence=low
Rice	`Os04g0612000` (KS2) - identity=35; qcov=0.857; evalue=8.54e-96; confidence=medium
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0010333 (terpene synthase activity); GO:0016102 (diterpenoid biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF01397 (Terpene_synth); PF03936 (Terpene_synth_C); PF19086 (Terpene_syn_C_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018203

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057802911.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802911.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057802911.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802911.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802911.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:6056399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B26
`Chr3:6062737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:6062823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr3:6062897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B53,C47
`Chr3:6065072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr3:6065072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:6065084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:6065091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:6065145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr3:6065179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr3:6065210`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A1,A14,B58,C17,C41
`Chr3:6065210`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A1,A14,B58,C17,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802911.1

596 aa

298

596

Terpene_synth

Terpene_synth_C

Terpene_syn_C_2

PF01397 Terpene_synth 53-213 aa PF03936 Terpene_synth_C 284-524 aa PF19086 Terpene_syn_C_2 323-523 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802911.1`	Pfam	`PF01397`	Terpene_synth	Repeat	53	213	5.9e-34	118.1	Terpene synthase, N-terminal domain
`XP_057802911.1`	Pfam	`PF03936`	Terpene_synth_C	Domain	284	524	1.2e-40	140.0	Terpene synthase family, metal binding domain
`XP_057802911.1`	Pfam	`PF19086`	Terpene_syn_C_2	Domain	323	523	1e-28	101.2	Terpene synthase family 2, C-terminal metal binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946928.1
TGAAGAAACATAGACCAAATTATACATACATGCTGCCATATTATAAATATAGATAGATATATGTTGGACAAAACAACCCAGATAAAATAAAATATATAGAGCCGGCAACCATCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGTAGAACTAAAAATGTCACTCGCCTTCAATACCGGTGTTACCCCTTTCTCCGGCCACAGAGTTGGGAGCAGGAGAGAAAATCTTCGAGTGCAAGGATTTCCGATGGCCACCACCAATAAGCCATCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018203
ATGTCACTCGCCTTCAATACCGGTGTTACCCCTTTCTCCGGCCACAGAGTTGGGAGCAGGAGAGAAAATCTTCGAGTGCAAGGATTTCCGATGGCCACCACCAATAAGCCATCTCTCACCGTTAAATGCAGCCTTACTACAACAATTGATTTGATGGGGAAAATAAAAGAGAAGTTGAAGGGGGAAGACGATAGTTCTCCGGCAACTGCGAGTGTTGAAGCTGTGAATAATATACCCTCTAATCTGTGTATAATCGACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802911.1
MSLAFNTGVTPFSGHRVGSRRENLRVQGFPMATTNKPSLTVKCSLTTTIDLMGKIKEKLKGEDDSSPATASVEAVNNIPSNLCIIDTLQRLGVDKYFQSEINTILDDTYKLWKQKHKVIYSTVSIHAMAFRLLRVKGYEVSSEELAPYANQERFSQQTIDVAMIIELYRAAQERIFEEESSLEKILAWTTTFLKHQLQTNSISDKKLHKLVEFYLNNYHGITIRLGVRRNLDLYDMSYYQAIKDTDRFSNLCNEDFLAFA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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