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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000589`

染色体: Chr03 坐标: 6541471-6543443 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000589`
名称	SmilChr03G000589
描述	uncharacterized SmilChr03G000589
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	6541471 - 6543443 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018211`
GeneID	`131018211`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018211`
原始查询	`LOC131018211`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=25.6; qcov=0.76; evalue=5.54e-41; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=36.2; qcov=0.867; evalue=1.47e-92; confidence=medium
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018211

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802919.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802919.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802919.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802919.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057802919.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:6541530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C87
`Chr3:6541547`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B54,C87
`Chr3:6541547`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B54,C87
`Chr3:6541550`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B54,C87
`Chr3:6541550`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B54,C87
`Chr3:6541554`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B54,C87
`Chr3:6541554`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B54,C87
`Chr3:6541557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C87
`Chr3:6541567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C87
`Chr3:6541582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B1,B115,B54,C87
`Chr3:6541620`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B1,B115,B32,B54,B89,C26,C87,D4
`Chr3:6541623`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B1,B115,B32,B54,B89,C26,C87,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802919.1

580 aa

290

580

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF10551 MULE 60-156 aa PF00872 Transposase_mut 94-182 aa PF04434 SWIM 306-341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802919.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	60	156	5.1e-17	62.8	MULE transposase domain
`XP_057802919.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	94	182	9.5e-05	22.2	Transposase, Mutator family
`XP_057802919.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	306	341	5e-10	39.4	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946936.1
ATGGTTAGAGGTTCAGTTGACCAACATTATGAAATGATCAACAATTATGTGGCTGAGTTGAGGAGAGTGGATCCAGATGGCAGATACGAGCTTCTTCTACAATCAGATAATGTTTTTAAAGCCTTTTACATGGGATTGAGTCCTTTGAGAGTAGGTTTTAAGGCCAGTTGCAGGCCTGTAATTGGGATTGATGGGTGTTTTCTGAAAACGTATTTGGGAGGGCATCTTCTCTGTGCCACAGGGAAATATGGGAATAATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018211
ATGGTTAGAGGTTCAGTTGACCAACATTATGAAATGATCAACAATTATGTGGCTGAGTTGAGGAGAGTGGATCCAGATGGCAGATACGAGCTTCTTCTACAATCAGATAATGTTTTTAAAGCCTTTTACATGGGATTGAGTCCTTTGAGAGTAGGTTTTAAGGCCAGTTGCAGGCCTGTAATTGGGATTGATGGGTGTTTTCTGAAAACGTATTTGGGAGGGCATCTTCTCTGTGCCACAGGGAAATATGGGAATAATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802919.1
MVRGSVDQHYEMINNYVAELRRVDPDGRYELLLQSDNVFKAFYMGLSPLRVGFKASCRPVIGIDGCFLKTYLGGHLLCATGKYGNNGMFPIAWAVVESENETCWNWFLQILCEELQMGDGTGWTFISDQQKGLQNAVAALAPEAEHRNCARHIYMNWKKVHKGQTLKNLFFRAVYATFEAEFKLAVQDLMDESPPAFEDFMARDTSKFCKAFISTHPKSDSVDNNISECFNGYILNARGKHVIHMLEEIRSSLMVRQVEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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