Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000597`

染色体: Chr03 坐标: 6620388-6622029 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000597`
名称	SmilChr03G000597
描述	uncharacterized SmilChr03G000597
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	6620388 - 6622029 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018214`
GeneID	`131018214`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018214`
原始查询	`LOC131018214`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018214

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057802922.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057802922.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057802922.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802922.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802922.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:6621086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A23,A4,B27,B35,B77,B9,B99,C26,C48,C71,C78
`Chr3:6621354`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	30	A18,B1,B11,B113,B123,B13,B140,B23,B35,B38,B39,B52,B53,B54,B55,B61,B62,B69,B7,B73,B80,B88,C21,C34,C4,C72,C75,C77,C86,D6
`Chr3:6621363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr3:6621366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C4
`Chr3:6621376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr3:6621385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B104,B12,B55
`Chr3:6621645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946939.1
ATGTCTCTTGGTGGTGCTATGGGTACAGTACCGGCGACTATATGCGGAACATTCTTGTTTCTTTATGGAAGGTCTGGCAAACTGGGTGATAATGAACATCGTCTAGTAGCTTACGAGTGGACTAAGGGAGACTGCAAGGAACTCGGTATTTATACTTATGGCGTTAAAAACCATATCCTTTGTTATGCTGAGGGCACCGTTGTGCTGCCCCATGGAAAGCTTGGAAAGGCAATCAATGGATCCTCATTTCTTATTAATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018214
ATGTCTCTTGGTGGTGCTATGGGTACAGTACCGGCGACTATATGCGGAACATTCTTGTTTCTTTATGGAAGGTCTGGCAAACTGGGTGATAATGAACATCGTCTAGTAGCTTACGAGTGGACTAAGGGAGACTGCAAGGAACTCGGTATTTATACTTATGGCGTTAAAAACCATATCCTTTGTTATGCTGAGGGCACCGTTGTGCTGCCCCATGGAAAGCTTGGAAAGGCAATCAATGGATCCTCATTTCTTATTAATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802922.1
MSLGGAMGTVPATICGTFLFLYGRSGKLGDNEHRLVAYEWTKGDCKELGIYTYGVKNHILCYAEGTVVLPHGKLGKAINGSSFLINPPLVKVPNLFIRHCGCKGNKGPGCECCQPYSDAYKFSVEDVAANGFRILRDTEEEVGPDISKNQLAGNPDAQGGKKRKHLRETSLDIICIRERVVRTYVQMSGIQWKHY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器