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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000688`

染色体: Chr03 坐标: 7680743-7682221 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000688`
名称	SmilChr03G000688
描述	uncharacterized SmilChr03G000688
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	7680743 - 7682221 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018244`
GeneID	`131018244`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018244`
原始查询	`LOC131018244`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824842]; symbol=AT3G56750; hit=AT3G56750; species=arabidopsis; confidence=high
产物	plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824842]; symbol=AT3G56750; hit=AT3G56750; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G56750` (AT3G56750) plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824842] identity=62; qcov=1.12; evalue=3.96e-99; confidence=high
Rice	`Os07g0641000` - identity=56.2; qcov=1.12; evalue=5.12e-94; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018244

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057802951.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057802951.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057802951.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802951.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802951.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:7680950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B129
`Chr3:7680969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B54,B63,D2
`Chr3:7681037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B44,B71
`Chr3:7681040`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A2,B101,B113,B122,B125,B128,B134,B14,B16,B31,B38,B40,B60,B79,B90,B93,C24,C29,C38,C61,C63,C7,C87
`Chr3:7681051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B120
`Chr3:7681055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B103,B23,B3,B54,B63,C11,C27
`Chr3:7681160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C23,C64,C66
`Chr3:7681161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr3:7681505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C13,C19,C85
`Chr3:7681799`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	22	A25,B10,B121,B130,B132,B16,B24,B30,B32,B40,B50,B65,B74,B93,C20,C22,C29,C40,C53,C6,C79,D2
`Chr3:7681827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A11,B104,B117,B125,B7,B78,B99,C11,C33,C44,C61,C63,C69,C73
`Chr3:7682219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946968.1
ATGTGGTTTCTGAGGAAGGGTGGGCAGGCAATGGATTCCCTGTATGATCTGGATTTCATGTCCAACACGGTGCCTGTGATTTTGGATAATTCGAAAACGTGGCACCATGTCCTTACTACAAGCATGAAACTGGGATCCAGAGGGATAGCACACGTGCGAGGAGTTAGTCGAACTGATCTCCAACAGAAAAAAATGTATTCAAATCTTCTACTCATAAATCGAACTGCCAGTCCACTCTCATGGTTCATGGAGTGCAAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018244
ATGTGGTTTCTGAGGAAGGGTGGGCAGGCAATGGATTCCCTGTATGATCTGGATTTCATGTCCAACACGGTGCCTGTGATTTTGGATAATTCGAAAACGTGGCACCATGTCCTTACTACAAGCATGAAACTGGGATCCAGAGGGATAGCACACGTGCGAGGAGTTAGTCGAACTGATCTCCAACAGAAAAAAATGTATTCAAATCTTCTACTCATAAATCGAACTGCCAGTCCACTCTCATGGTTCATGGAGTGCAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802951.1
MWFLRKGGQAMDSLYDLDFMSNTVPVILDNSKTWHHVLTTSMKLGSRGIAHVRGVSRTDLQQKKMYSNLLLINRTASPLSWFMECKDRNNRSSIMLPYSFLPSMAAKKLRDAAEKVIHCNLATFRPGRTLFIASNERTPGFFSPLSVRYKLAYSSNYSSLLDPIIENNYQLFMVERLIMMGAKSFIRTFKEDDTDLSLTDDPKKNTKIWQIPVYTREVGEGDNC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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