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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000767`

染色体: Chr03 坐标: 8779824-8781497 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000767`
名称	SmilChr03G000767
描述	disease resistance protein RPM1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	8779824 - 8781497 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018262`
GeneID	`131018262`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018262`
原始查询	`LOC131018262`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RPM1-like
产物	disease resistance protein RPM1-like
Arabidopsis	`AT3G07040` (RPM1) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819889] identity=24.8; qcov=0.718; evalue=2.04e-20; confidence=weak
Rice	`Os06g0330100` (Pid3) - identity=29; qcov=0.804; evalue=8.07e-27; confidence=low
GO	GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018262

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057802967.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057802967.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057802967.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802967.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802967.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:8779918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,C10,C30,C65
`Chr3:8779934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C60
`Chr3:8779991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C60
`Chr3:8779996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:8779999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr3:8780000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C30,C65
`Chr3:8780002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C14
`Chr3:8780082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B13,C6
`Chr3:8780114`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	44	A16,A18,A7,B1,B104,B108,B121,B126,B25,B3,B30,B31,B37,B49,B53,B58,B63,B64,B75,B77,B81,B82,B83,B9,C11,C14,C2,C22,C24,C27,C30,C44,C47,C53,C57,C58,C60,C64,C66,C69,C74,C8,D4,D9
`Chr3:8780129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:8780147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,B9,C26
`Chr3:8780150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802967.1

433 aa

216

433

LRR_14

PF23598 LRR_14 205-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802967.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	205	316	2.8e-18	66.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946984.1
ATGAACTTGCAGCCTATGGCAAAACAAATGTTGAGAAAATGCGGCGGTCTGCCATTAGCTATAAAAGAGGTGGGAAAGCAGTTAGCAGAAAAGAAAGTCTCGGGAAGGAGTGGATGGGAACAACTTCTTGAATCGGTTGATTTTGGTTCAACATTGAAGTTATTGGAACCGTTTTATCAGAAATTGGATCCCAAACTGGAGCCATGTTTCATGTGTATGGCCTTCTTCAAGGAAAATACAACTTTGAGGGCGGAAAAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018262
ATGAACTTGCAGCCTATGGCAAAACAAATGTTGAGAAAATGCGGCGGTCTGCCATTAGCTATAAAAGAGGTGGGAAAGCAGTTAGCAGAAAAGAAAGTCTCGGGAAGGAGTGGATGGGAACAACTTCTTGAATCGGTTGATTTTGGTTCAACATTGAAGTTATTGGAACCGTTTTATCAGAAATTGGATCCCAAACTGGAGCCATGTTTCATGTGTATGGCCTTCTTCAAGGAAAATACAACTTTGAGGGCGGAAAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802967.1
MNLQPMAKQMLRKCGGLPLAIKEVGKQLAEKKVSGRSGWEQLLESVDFGSTLKLLEPFYQKLDPKLEPCFMCMAFFKENTTLRAEKLTQIWVAGGVVSRYKYESYLNGLINESVIDVQDKSTEYRMNHVLHMLSIQKAEEKLGFEILRNNGNNRPSESPRHHRVTICSRDKFNYSTDQDKHLVSLFFHGGGYLDASPSYWKSFKQRLKILDLEDFGLKILPETISTLMELRYLGLRNYYIKELPQSLGRLKNLEVLDIAQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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