当前解析结果
SmilChr03G000788| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000788 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000788 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000788 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 8978757 - 8979959 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018268 |
|---|---|
| GeneID | 131018268 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018268 |
| 原始查询 | LOC131018268 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018268 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057802973.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057802973.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802973.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057802973.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057802973.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:8978843 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr3:8978891 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B41,C50,D7 |
Chr3:8978900 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr3:8978915 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A5,B41 |
Chr3:8978924 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A5,B79,C50 |
Chr3:8979066 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B19,C30 |
Chr3:8979083 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B59 |
Chr3:8979085 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A7,B46,C4 |
Chr3:8979089 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A7,B19,B46,C30,C4 |
Chr3:8979158 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B101,B106,B46,C35,C71 |
Chr3:8979164 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C63 |
Chr3:8979165 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | A3,B137,B28,C25,C28,C63,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。