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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000166`

染色体: Chr01 坐标: 2736844-2737206 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000166`
名称	SmilChr01G000166
描述	uncharacterized SmilChr01G000166
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	2736844 - 2737206 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018271`
GeneID	`131018271`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018271`
原始查询	`LOC131018271`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os07g0546750; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os07g0546750; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=63.5; qcov=0.433; evalue=1.01e-16; confidence=low
Rice	`Os07g0546750` - identity=47; qcov=0.975; evalue=5.46e-28; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018271

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803190.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057803190.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803190.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803190.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803190.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:2736916`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C8
`Chr1:2736916`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C8
`Chr1:2737053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A5,C27,C37
`Chr1:2737072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,B40
`Chr1:2737090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B106
`Chr1:2737144`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A1,A11,A16,A2,A21,B12,B127,B129,B134,B137,B14,B17,B2,B21,B23,B3,B31,B56,B60,B68,B86,B89,B96,B99,C10,C3,C36,C4,C42,C44,C61,C62,C72,C87,D11,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803190.1

120 aa

120

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 2-54 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803190.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	2	54	8e-20	72.1	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947207.1
ATGCAAAAAGCTGCAAGAAAGGATGTGGAACGAGCTTTCGGTGTTCTTCAGGCTCGGTGGGGTATAATTAAAGGACCGTCGCGTTTGTGGAAGGCGGAGCAAATGAGTTCGATCATGTTTGCATACATCATATTGCACAACATGATCATTGAGGAAGAAGGTGGAAATGCAAGTAATTTTGACGGTGACGACGGCGAGGGACCAAGTTCTACTCCTCAAACACAATTCAATTCCGGAGCACCACCGGAGTTCGCCGCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018271
ATGCAAAAAGCTGCAAGAAAGGATGTGGAACGAGCTTTCGGTGTTCTTCAGGCTCGGTGGGGTATAATTAAAGGACCGTCGCGTTTGTGGAAGGCGGAGCAAATGAGTTCGATCATGTTTGCATACATCATATTGCACAACATGATCATTGAGGAAGAAGGTGGAAATGCAAGTAATTTTGACGGTGACGACGGCGAGGGACCAAGTTCTACTCCTCAAACACAATTCAATTCCGGAGCACCACCGGAGTTCGCCGCCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803190.1
MQKAARKDVERAFGVLQARWGIIKGPSRLWKAEQMSSIMFAYIILHNMIIEEEGGNASNFDGDDGEGPSSTPQTQFNSGAPPEFAAYLARNASLKDARLHARLRDDLVEHIWARFGPVDP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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