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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000803`

染色体: Chr03 坐标: 9184666-9187348 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000803`
名称	SmilChr03G000803
描述	transcription factor MYB30-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	9184666 - 9187348 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018273`
GeneID	`131018273`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018273`
原始查询	`LOC131018273`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYB30-like
产物	transcription factor MYB30-like
Arabidopsis	`AT1G79180` (MYB63) myb domain protein 63 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844259] identity=54.9; qcov=0.657; evalue=1.88e-48; confidence=medium
Rice	`Os10g0478300` (MYB110) - identity=57.5; qcov=0.556; evalue=8.54e-48; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018273

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802979.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802979.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802979.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802979.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057802979.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:9184686`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	36	A10,B1,B127,B19,B24,B26,B35,B36,B40,B41,B42,B43,B5,B55,B57,B65,B77,B89,C12,C16,C17,C3,C30,C34,C35,C39,C5,C50,C70,C75,C77,C82,C83,C9,D4,D5
`Chr3:9184703`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A21,B1,B35,B36,B57,B89,C16,C17,C30,C34,C35,C5,C50,C70,C75,D4
`Chr3:9184831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B50
`Chr3:9186966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,D9
`Chr3:9187009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,D9
`Chr3:9187040`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B111
`Chr3:9187040`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B111
`Chr3:9187041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B131,D9
`Chr3:9187042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B127,B131,B65,D9
`Chr3:9187335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802979.1

216 aa

108

216

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 14-61 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 17-76 aa PF00249 Myb_DNA-binding 67-109 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 70-129 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802979.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	14	61	1e-33	115.9	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057802979.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	17	76	9.9e-23	80.8	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057802979.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	67	109	1e-33	115.9	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057802979.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	70	129	9.9e-23	80.8	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946996.1
ATGGTGAAACGTACTTACGTTGACAAAAATGGAACGACAAAAGGTGCGTGGACAGAAGAAGAAGACCATAAGTTGAGAGCTTATGTTGAGCGTTTCGGCCATTCGAACTGGAGATTGCTTCCCAACTCTGCAGGTCTAAATAGATGTGGAAAGAGTTGCAGATTGCGATGGATGAACCACTTGAAACCTGGCCTAAAACGAGGGGGTTTCACCCAAGAAGAAAAAGATCTTATCGAAAAACTTCATCATCAACATGGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018273
ATGGTGAAACGTACTTACGTTGACAAAAATGGAACGACAAAAGGTGCGTGGACAGAAGAAGAAGACCATAAGTTGAGAGCTTATGTTGAGCGTTTCGGCCATTCGAACTGGAGATTGCTTCCCAACTCTGCAGGTCTAAATAGATGTGGAAAGAGTTGCAGATTGCGATGGATGAACCACTTGAAACCTGGCCTAAAACGAGGGGGTTTCACCCAAGAAGAAAAAGATCTTATCGAAAAACTTCATCATCAACATGGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802979.1
MVKRTYVDKNGTTKGAWTEEEDHKLRAYVERFGHSNWRLLPNSAGLNRCGKSCRLRWMNHLKPGLKRGGFTQEEKDLIEKLHHQHGNKWSAIAAELPGRTDHEIKNYWHAHHKNYRDQSKPSKSSDQELSSCSSVVTSSVAPKLSHISPLQLFILESNDSSTQQNCSNVSAITTQNSDGFHDTFWTQPFMVETDSDYDYDFSVFSPLFHIPDSYML

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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