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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000833`

染色体: Chr03 坐标: 9556772-9558457 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000833`
名称	SmilChr03G000833
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	9556772 - 9558457 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018280`
GeneID	`131018280`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018280`
原始查询	`LOC131018280`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
产物	disease resistance RPP8-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=27.5; qcov=1; evalue=2.7e-35; confidence=low
Rice	`Os08g0193700` - identity=26.3; qcov=1.02; evalue=9.44e-35; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0006952 (defense response); GO:0043531 (ADP binding)
KEGG	-
Pfam	PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018280

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057802988.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802988.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057802988.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057802988.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802988.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:9556795`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B111,B54,B7,B73,D7
`Chr3:9556795`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B111,B54,B7,B73,D7
`Chr3:9556808`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C56,C62
`Chr3:9556808`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C56,C62
`Chr3:9556813`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C56,C62
`Chr3:9556813`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C56,C62
`Chr3:9556820`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C56,C62
`Chr3:9556820`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C56,C62
`Chr3:9556869`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	B104,B111,B134,B16,B34,B38,B43,B62,B66,B92,B93,C15,C16,C17,C59,C7,C79,C84,D4,D5
`Chr3:9556877`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B137,B63
`Chr3:9556877`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B137,B63
`Chr3:9556889`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	B104,B111,B134,B16,B34,B38,B43,B62,B66,B92,B93,C15,C16,C17,C59,C7,C79,C84,C9,D4,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802988.1

561 aa

280

561

LRR_14

PF23598 LRR_14 241-514 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802988.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	241	514	2.2e-33	116.2	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947005.1
ATGGAGATGCCTGTTTTTGATGTTCATGAGATGAAAACTTTGGATTCTAAGAAGAGCTGGCAATTGTTTTTGAAAACAATAAACCATGGCAACAAATTGATGGGCGAACACAAATTCCCAATGAAGTTTGAGCGTATGGGAAAACAAATGTTGAGAAAATGTGGCGGTCTGCCGTTAGCTATAAAAGAGGTGGGAAAGCAGTTAGTGGAAAAGAAACTCTCAAGACGGGGTGAATGGGAACAACTTCTTGAATCAGTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018280
ATGGAGATGCCTGTTTTTGATGTTCATGAGATGAAAACTTTGGATTCTAAGAAGAGCTGGCAATTGTTTTTGAAAACAATAAACCATGGCAACAAATTGATGGGCGAACACAAATTCCCAATGAAGTTTGAGCGTATGGGAAAACAAATGTTGAGAAAATGTGGCGGTCTGCCGTTAGCTATAAAAGAGGTGGGAAAGCAGTTAGTGGAAAAGAAACTCTCAAGACGGGGTGAATGGGAACAACTTCTTGAATCAGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802988.1
MEMPVFDVHEMKTLDSKKSWQLFLKTINHGNKLMGEHKFPMKFERMGKQMLRKCGGLPLAIKEVGKQLVEKKLSRRGEWEQLLESVDFGSTLKLLEPFYNKLDPKLDSCFLSMAFFKENTTLRAEKLTQIWVVGGVVDSEDECKPYLDGLVNESFIAVKDKSTEYSMNTLLHMLSIQKAEEKLSFEIQRNNGNNRPSESPRHHRVIICSRDKFNYSTDKDKLLISLFFHGGGYFDTNSSYWKSFEQLKILDLEDFGLKTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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