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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000857`

染色体: Chr03 坐标: 9789202-9796605 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000857`
名称	SmilChr03G000857
描述	putative inactive disease susceptibility protein LOV1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	9789202 - 9796605 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018288`
GeneID	`131018288`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018288`
原始查询	`LOC131018288`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative inactive disease susceptibility protein LOV1
产物	putative inactive disease susceptibility protein LOV1
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=28.4; qcov=0.907; evalue=6.89e-57; confidence=low
Rice	`Os10g0358200` - identity=25.6; qcov=1.13; evalue=8.31e-54; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018288

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802997.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802997.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802997.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802997.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802997.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:9789774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr3:9789776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B115,B51,B67
`Chr3:9789776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B51,B67
`Chr3:9789791`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B75
`Chr3:9789791`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B75
`Chr3:9789814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	104	A1,A10,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A24,A8,B10,B106,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B12,B120,B127,B128,B129,B130,B132,B134,B135,B137,B16,B18,B20,B21,B23,B26,B28,B29,B36,B37,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B54,B55,B56,B62,B63,B70,B71,B73,B74,B76,B80,B83,B85,B88,B89,B90,B91,B92,B95,B96,C1,C12,C15,C22,C23,C24,C27,C29,C35,C36,C37,C4,C43,C48,C5,C50,C52,C59,C60,C61,C62,C63,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C76,C78,C79,C81,C86,C87,C9,D11,D2,D9
`Chr3:9789836`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	B110,B114,B125,B133,B134,B21,B35,B36,B62,B64,B66,B71,B90,B95,B97,C15,C24,C32,C49,C67,C9
`Chr3:9789848`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	B110,B114,B125,B133,B134,B21,B35,B36,B62,B64,B66,B71,B90,B95,B97,C15,C24,C32,C49,C67,C9
`Chr3:9789852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,B9,C18,C8
`Chr3:9789881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B6
`Chr3:9789914`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A14,A18,A23,B114,B15,B19,B27,B3,B44,B47,B51,B7,B78,C17,C41,C47,C53,C86
`Chr3:9789920`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A14,A18,A23,B114,B15,B19,B27,B3,B44,B47,B51,B7,B78,C17,C41,C47,C53,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802997.1

787 aa

394

787

NB-ARC

LRR_14

PF00931 NB-ARC 151-310 aa PF23598 LRR_14 525-771 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802997.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	151	310	2e-28	99.8	NB-ARC domain
`XP_057802997.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	525	771	4.2e-29	102.1	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947014.1
TTAGCTATCCAAAAACAAGGAGAGAGGGAGCAAAGATAAGAAGAAATTTCACAAAAAAGGATTCATTGGAAGAGCAAGACCAGCTAATTTGATTAGAAGGGAGGATTGAATCAAAAAGTCGATCAACACGAGCAAAGATAAGAAGAGAAATCACAAAAGGTTTGGTGGAAGCAGAAACATGTCGGAGGCCCTCCTCTTATCGGTGATACAGAAGCTCGACGAAATTAAAGAGCTTGAAGAGTACTATAATTATTGGGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018288
ATGTCGGAGGCCCTCCTCTTATCGGTGATACAGAAGCTCGACGAAATTAAAGAGCTTGAAGAGTACTATAATTATTGGGACACAGAGTACTATAGTTATCCAGAGCTTGAAGAGCTCTTGAAAAGCGTAATTAAAGAGATGAGAAAGATTGTGGATATTGTGAGGGATAAGAAATTGGAAGAGAGAAGAAGCCCAAATTTTTTGGTATGTGATCTTGTCGACGTGGCAGACGATGCCCTCTACTTTCTCAAACTCAAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802997.1
MSEALLLSVIQKLDEIKELEEYYNYWDTEYYSYPELEELLKSVIKEMRKIVDIVRDKKLEERRSPNFLVCDLVDVADDALYFLKLKQYSSFSSYYDTIHGWMGEIQKQMLNLGGDESNIRSSQNVEDDVDVVGLDEDVGILISKKIIGGGEDLNNILIKGMAGIGKTTLAREIFNHPTVVDRFERRAWVSNSTYFTMKELLIKLIQQLEDPQNLHAYSLLENMDNPSLRDTLYKHLQGKRYLIVLDDMRKQMRLRSFLNA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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