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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000920`

染色体: Chr03 坐标: 10524765-10526411 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000920`
名称	SmilChr03G000920
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	10524765 - 10526411 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018300`
GeneID	`131018300`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018300`
原始查询	`LOC131018300`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
产物	disease resistance RPP8-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=26.9; qcov=1.03; evalue=6.45e-33; confidence=low
Rice	`Os01g0547000` - identity=26.4; qcov=1.04; evalue=2.4e-36; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018300

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803009.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803009.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803009.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803009.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803009.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:10524791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:10524797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B1,B37,C39
`Chr3:10524833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr3:10524835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr3:10524837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr3:10524851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr3:10524926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C48
`Chr3:10524955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:10524962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B67,B69,B73,C4
`Chr3:10525024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B70,C61
`Chr3:10525066`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B1,B106,B19,B6,B68,C19,C7
`Chr3:10525067`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B106,B19,B6,B68,C19,C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803009.1

548 aa

274

548

LRR_14

LRR_8

PF23598 LRR_14 230-480 aa PF13855 LRR_8 257-310 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803009.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	230	480	8.9e-27	94.5	Leucine-rich repeat region
`XP_057803009.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	257	310	8.4e-11	42.2	Leucine rich repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947026.1
ATGAAACCTTTGGATTCTAAAAAGAGCTGGCAGTTGTTTTTGAAAACAATAAACCATGGCAATAAATTGACGGGTGAGCATAAATTCCCAAAGTCCTTGGAGCCTAAGGGAAAACAAATGTTGAGAAAATGTGACGGCCTGCCATTAGCTATAAAAGAGGTGGGAAAGCAGTTAGTGGAAAAGAAACTCTCAGGGGGGAGTGAATGGGAACAACTTCTTGAATCAGTTGATTTTGGTTCAACACTCAAGTTATTGGAACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018300
ATGAAACCTTTGGATTCTAAAAAGAGCTGGCAGTTGTTTTTGAAAACAATAAACCATGGCAATAAATTGACGGGTGAGCATAAATTCCCAAAGTCCTTGGAGCCTAAGGGAAAACAAATGTTGAGAAAATGTGACGGCCTGCCATTAGCTATAAAAGAGGTGGGAAAGCAGTTAGTGGAAAAGAAACTCTCAGGGGGGAGTGAATGGGAACAACTTCTTGAATCAGTTGATTTTGGTTCAACACTCAAGTTATTGGAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803009.1
MKPLDSKKSWQLFLKTINHGNKLTGEHKFPKSLEPKGKQMLRKCDGLPLAIKEVGKQLVEKKLSGGSEWEQLLESVDFGSTLKLLEPFYHKLDPELESCFLYMSFFKENTTLRAEKLTQIWIAGGVVSGYCGSYLDGLINESVIDVKDKSTKYRMNALLHMLSIQKAEEKLGFEILRNNGNNRSFPSPRLHRIIICSRDKFNYSTDQDKHLVSLFFHGGGYFDTSPSYWNSFEELNILDLEDFGLKNLPESISTLIELKY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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