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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001459`

染色体: Chr01 坐标: 28356480-28359703 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001459`
名称	SmilChr01G001459
描述	ubiquinol oxidase, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	28356480 - 28359703 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018305`
GeneID	`131018305`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018305`
原始查询	`LOC131018305`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquinol oxidase, mitochondrial
产物	ubiquinol oxidase%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G64210` (AOX2) alternative oxidase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836542] identity=77.6; qcov=0.846; evalue=5.48e-165; confidence=high
Rice	`Os04g0600200` (AOX1A) - identity=77.5; qcov=0.762; evalue=8.53e-155; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0009916 (alternative oxidase activity); GO:0010230 (alternative respiration)
KEGG	-
Pfam	PF01786 (AOX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018305

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057803016.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057803016.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057803016.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803016.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803016.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:28356723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr1:28356750`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A23
`Chr1:28356750`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A23
`Chr1:28356908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr1:28357009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr1:28359422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803016.1

332 aa

166

332

AOX

PF01786 AOX 122-313 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803016.1`	Pfam	`PF01786`	AOX	Domain	122	313	3e-83	279.5	Alternative oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947033.1
AAATGTCGCATCTTTTTTGAATAATCACTTACATCTCATCCACATACACCAACCACTCAGGTCACGCCACGTCGCCATATCGGTGGCGGCAATCATCTACTCCACCGAATCACGTTATTTGCTCCCCCCGGATATAATAATATACAAACCCCCCACAGACGCATATTAATTAATCTGGAAAAGGAAATTGAGAGACACTGTTTGTGTGAATCACCGGTGAAAAAATGAACCACTTGGTCGCCAGATCACTGATGCGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018305
ATGAACCACTTGGTCGCCAGATCACTGATGCGCCGCGCGGTCTCCGGCGGTAACTGCCGCCGGTACGTGGCGGCGGCGTCGGGGACGTCCGGCGTGCAGATTGAGGGTTTGAGCGCGGCGTTGGTAGGGTGGAGGCGGATGATGAGTTCGGCAGCAGAGCCTACGTCGTCGCCGCCATCGGTGGAGAAGAAGATGAACAACAGCGAGTTGCAGACGGAGAAGGCGGAGAAAGGTGGTGCGGTGGTTTCGAGCTATTGGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803016.1
MNHLVARSLMRRAVSGGNCRRYVAAASGTSGVQIEGLSAALVGWRRMMSSAAEPTSSPPSVEKKMNNSELQTEKAEKGGAVVSSYWGISRPKIKREDGTEWPWNCFMPWETYAADLSIDLHKHHVPKTFMDKVAFRTVKLLRIPTDVFFKRRYGCRAMMLETVAAVPGMVGGMLLHLRSLRKFQQSGGWIKALLEEAENERMHLMTMVELVKPKWYERLLVLTVQGVFFNGFFVIYMVSPKLAHRIVGYLEEEAIHSYTE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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