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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000952`

染色体: Chr03 坐标: 10775092-10776276 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000952`
名称	SmilChr03G000952
描述	probable disease resistance protein At1g58602
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	10775092 - 10776276 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018311`
GeneID	`131018311`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018311`
原始查询	`LOC131018311`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein At1g58602
产物	probable disease resistance protein At1g58602
Arabidopsis	`AT1G59218` (AT1G59218) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842234] identity=33.1; qcov=0.782; evalue=3.58e-22; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=28.7; qcov=1; evalue=1.16e-23; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018311

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057803019.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803019.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803019.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803019.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803019.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:10775154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr3:10775160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr3:10775179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr3:10775189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr3:10775194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,A22,B62,C27
`Chr3:10775201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,A16,B26,B4
`Chr3:10775208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B62,B88,B98
`Chr3:10775230`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B127
`Chr3:10775230`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B127
`Chr3:10775237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C64,C66
`Chr3:10775300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B108
`Chr3:10775346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803019.1

394 aa

197

394

LRR_14

PF23598 LRR_14 75-347 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803019.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	75	347	3.4e-29	102.4	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947036.1
ATGAATGTTGTGCTACACATGCTATCCGTCCGAAAAGCAGAGGAGAAATTTGGTTTTGAGATCCTAAGGAATAATGAAAATAATCGACCATGTCAAAGTCCTCGTCATCGTGTTATCATTTGTAGCAGAGACAAGTTCAACTACTCCACGGATCAAGATAAGCTTCTTGTTTCTCTCTTCTTCCATGGAGGTGGCTATTTCAACACTAGTTCGTCTTATTGGAAGGGCTTTGAACAACTTAAGATACTGGACTTGGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018311
ATGAATGTTGTGCTACACATGCTATCCGTCCGAAAAGCAGAGGAGAAATTTGGTTTTGAGATCCTAAGGAATAATGAAAATAATCGACCATGTCAAAGTCCTCGTCATCGTGTTATCATTTGTAGCAGAGACAAGTTCAACTACTCCACGGATCAAGATAAGCTTCTTGTTTCTCTCTTCTTCCATGGAGGTGGCTATTTCAACACTAGTTCGTCTTATTGGAAGGGCTTTGAACAACTTAAGATACTGGACTTGGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803019.1
MNVVLHMLSVRKAEEKFGFEILRNNENNRPCQSPRHRVIICSRDKFNYSTDQDKLLVSLFFHGGGYFNTSSSYWKGFEQLKILDLEDFGLKILPESIGTLIELRYLGLRNNYLQELLESLGWLKKLEVLDIAQNFMVKVPDIIRELSSLRHLYLFDVIFRKPLKIDVLQNLETLTYVSADNWTHERSVYGNLFSLKKLGIEELNGNLDVSKLFTSLVDLKNLNHLILRGYRFRSMPCLDDLYILHRLKTLKLDGFLATLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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