当前解析结果
SmilChr03G001018| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001018 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001018 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001018 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 11711038 - 11712571 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018326 |
|---|---|
| GeneID | 131018326 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018326 |
| 原始查询 | LOC131018326 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=37.5; qcov=0.463; evalue=1.12e-41; confidence=medium |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018326 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803033.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057803033.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803033.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803033.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057803033.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:11711052 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B16,B49 |
Chr3:11711083 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B56,C44 |
Chr3:11711691 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C55,D2 |
Chr3:11711716 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B67 |
Chr3:11711724 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B99 |
Chr3:11711760 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B72,C69 |
Chr3:11711829 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C24 |
Chr3:11711994 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B86 |
Chr3:11712001 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 36 | A1,A20,B1,B10,B100,B103,B113,B122,B130,B133,B137,B140,B15,B18,B23,B6,B61,B63,B77,B81,B83,B86,C14,C23,C36,C43,C50,C56,C57,C67,C76,C81,C86,D1,D6,D9 |
Chr3:11712021 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B117,B131,B9 |
Chr3:11712034 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B106,B99,C26 |
Chr3:11712049 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B106,B67,B99,C26 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。