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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001026`

染色体: Chr03 坐标: 11975015-11978263 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001026`
名称	SmilChr03G001026
描述	plasmodesmata-located protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	11975015 - 11978263 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018329`
GeneID	`131018329`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018329`
原始查询	`LOC131018329`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plasmodesmata-located protein 2-like
产物	plasmodesmata-located protein 2-like
Arabidopsis	`AT3G04370` (PDLP4) plasmodesmata-located protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819592] identity=34.9; qcov=1.07; evalue=2.79e-38; confidence=low
Rice	`Os03g0140500` - identity=34.1; qcov=0.895; evalue=1.01e-28; confidence=low
GO	GO:0009506 (plasmodesma); GO:0010497 (plasmodesmata-mediated intercellular transport); GO:0046739 (transport of virus in multicellular host)
KEGG	-
Pfam	PF01657 (Stress-antifung)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018329

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057803037.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803037.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803037.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803037.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803037.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:11977842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C8
`Chr3:11977863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr3:11977865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C8
`Chr3:11978204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,B76
`Chr3:11978231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803037.1

295 aa

148

295

Stress-antifung

PF01657 Stress-antifung 42-127 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803037.1`	Pfam	`PF01657`	Stress-antifung	Family	42	127	3.6e-19	70.0	Salt stress response/antifungal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947054.1
TATCCATGATTAATCCCACCATAATCCAGTTCCTAATCCCATTTTTTCTCCTCATAATCGCACATTCCGCCAAAACCCTAATCACAGACCACCACAAATTAGTATACACACAATGCTCAAACCATACCTCACCAAATCCCTCTCACGTTTTGTTACTCCCAAATCTATTTCAAGAACTCATCACACACTCTTCCAAAGCCGCCTTCTTCAAAACCATCGTCGGAGATGAGAAAACCGCGATTTCGGGTTTGTTTCAATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018329
ATGATTAATCCCACCATAATCCAGTTCCTAATCCCATTTTTTCTCCTCATAATCGCACATTCCGCCAAAACCCTAATCACAGACCACCACAAATTAGTATACACACAATGCTCAAACCATACCTCACCAAATCCCTCTCACGTTTTGTTACTCCCAAATCTATTTCAAGAACTCATCACACACTCTTCCAAAGCCGCCTTCTTCAAAACCATCGTCGGAGATGAGAAAACCGCGATTTCGGGTTTGTTTCAATGCAGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803037.1
MINPTIIQFLIPFFLLIIAHSAKTLITDHHKLVYTQCSNHTSPNPSHVLLLPNLFQELITHSSKAAFFKTIVGDEKTAISGLFQCRKDLSSDECRNCVITSSDLSENLCGKILPARIQLRGCYVRYEGEEDGAEPETDAGPEQILHRACSKRKIKRDKFEVIKYAAFGEVERCVTSENGFCELAYESIRVSAQCVGSLRSTCDCGECVARAAEIACEDECRYSAAGEVYADGCFLSYDYIGEGGFGTYKGGGDRSPKLVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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