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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001042`

染色体: Chr03 坐标: 12135170-12136301 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001042`
名称	SmilChr03G001042
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g06240-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12135170 - 12136301 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018333`
GeneID	`131018333`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018333`
原始查询	`LOC131018333`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g06240-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g06240-like
Arabidopsis	`AT3G06240` (AT3G06240) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819798] identity=28.9; qcov=1.07; evalue=1.12e-20; confidence=low
Rice	`Os10g0566300` (OsFbox561) - identity=25.2; qcov=0.905; evalue=2.36e-12; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018333

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803042.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803042.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803042.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803042.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803042.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12135235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B66
`Chr3:12135249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr3:12135340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr3:12135388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr3:12135641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B27,C38,C7
`Chr3:12135687`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B59,B86
`Chr3:12135687`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B59,B86
`Chr3:12135730`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A10,B11,B111,B113,B132,B138,B17,B27,B28,B40,B53,B59,B65,B83,B86,B97,C14,C20,C30,C38,C40,C5,C50,C7,D10,D5,D9
`Chr3:12135741`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A10,B11,B111,B113,B132,B138,B17,B27,B28,B40,B53,B59,B65,B86,B97,C14,C20,C30,C38,C40,C5,C50,C7,D5,D9
`Chr3:12135758`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B113,B59,B86,C14,C20,C50,D9
`Chr3:12135759`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A10,B11,B111,B132,B17,B27,B28,B40,B97,C30,C38,C40,C5,C7,D10,D5
`Chr3:12135762`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A10,B11,B111,B132,B17,B27,B28,B40,B97,C30,C38,C40,C5,C7,D10,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803042.1

368 aa

184

368

F-box

FBA_3

FBA_1

PF00646 F-box 13-53 aa PF08268 FBA_3 111-305 aa PF07734 FBA_1 118-318 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803042.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	13	53	1.9e-05	25.1	F-box domain
`XP_057803042.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	111	305	2.2e-15	57.2	F-box associated beta propeller domain
`XP_057803042.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	118	318	4e-17	62.9	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947059.1
TACAAAAACCTCGGCAGCTTTGGGTATGGAGATCGAAAGAAGTAGGTTGCAATCTCTCCCTCTTCCAGATGAAATCATCGATGACATATTGTCGAGACTGTTTATATTGCCGGTGAAATCACTGTTAAGATTCAGGTGCATTTCGAAATCATGGCGGTCTTTAATTGGCAGCAAAAGCTTCATCAAAACCCAGCATCAAAATTCAATGAAAAACCCATGTTTTCCCCATCAAAGGCTCATTATACAGAAGAATTGTTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018333
ATGGAGATCGAAAGAAGTAGGTTGCAATCTCTCCCTCTTCCAGATGAAATCATCGATGACATATTGTCGAGACTGTTTATATTGCCGGTGAAATCACTGTTAAGATTCAGGTGCATTTCGAAATCATGGCGGTCTTTAATTGGCAGCAAAAGCTTCATCAAAACCCAGCATCAAAATTCAATGAAAAACCCATGTTTTCCCCATCAAAGGCTCATTATACAGAAGAATTGTTCTGGTGTGCCTTATAGTATGGATTGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803042.1
MEIERSRLQSLPLPDEIIDDILSRLFILPVKSLLRFRCISKSWRSLIGSKSFIKTQHQNSMKNPCFPHQRLIIQKNCSGVPYSMDWPEQCSLQSVLSGPINTIPLSLVAYPTNTTAMGYEIVGSCNGLVCLLEMIKPNRIQLWNPSTRISKILPEISSPGKVSNIGFGWVESSDEYKVFVHLYDTNYYQDGKIYSSKTKSWKTIEPCYDLFSYCCDGVFAGGKLYWKIKYGDAIFFLDLKSEVFGRIEIPFDQEMFGEID...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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