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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001050`

染色体: Chr03 坐标: 12227228-12228491 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001050`
名称	SmilChr03G001050
描述	uncharacterized SmilChr03G001050
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12227228 - 12228491 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018336`
GeneID	`131018336`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018336`
原始查询	`LOC131018336`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0606500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0606500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G50950` (ZAR1) HOPZ-ACTIVATED RESISTANCE 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824259] identity=38.6; qcov=0.283; evalue=2.38e-13; confidence=weak
Rice	`Os11g0606500` - identity=34.3; qcov=0.46; evalue=4.54e-17; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018336

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803045.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057803045.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057803045.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803045.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803045.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12227259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C59
`Chr3:12227261`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr3:12227261`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr3:12228001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C73
`Chr3:12228025`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A9,C16
`Chr3:12228025`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A9,C16
`Chr3:12228041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C16
`Chr3:12228059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C16
`Chr3:12228105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B54,C73,C77
`Chr3:12228120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr3:12228174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C36
`Chr3:12228190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803045.1

311 aa

156

311

WHD_DRP

PF23559 WHD_DRP 4-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803045.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	4	74	7.5e-21	74.7	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947062.1
ATGACTGGCTTTCCAGAAGATTATGAGATTCGTGTCTCAGAACTTATTCACCTTTGGATAGCTGAGGGTATTGTAACACTTTCAAATGGATCAAAAAGCTTGGAAGAGGAGGCAGAAGATTGTTTCGATGATCTTGTCGAGAGAAGTCTAGTTCTGGTCATCAACAGGAAGTCTAATGGGAAAATAAAGAGTTGCAGCATTCATGATATTGTGCGAGAATTTCTGGTAAGGCAGGCTGCAAAAGAGAAGGTTGCGACAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018336
ATGACTGGCTTTCCAGAAGATTATGAGATTCGTGTCTCAGAACTTATTCACCTTTGGATAGCTGAGGGTATTGTAACACTTTCAAATGGATCAAAAAGCTTGGAAGAGGAGGCAGAAGATTGTTTCGATGATCTTGTCGAGAGAAGTCTAGTTCTGGTCATCAACAGGAAGTCTAATGGGAAAATAAAGAGTTGCAGCATTCATGATATTGTGCGAGAATTTCTGGTAAGGCAGGCTGCAAAAGAGAAGGTTGCGACAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803045.1
MTGFPEDYEIRVSELIHLWIAEGIVTLSNGSKSLEEEAEDCFDDLVERSLVLVINRKSNGKIKSCSIHDIVREFLVRQAAKEKVATIKTLSLATDFVCSKRMVEMIPNIKKLGICYSKEKSDADAGYRLNNLKYLCRLEKLKLEMPEGSLSRKQYDEMTLRMLGGFSFRLVDKILGWISFRQADKILGGINFPLQLRRLTLSGWKLPSSDMSIVGSLPNLQVLKLRNFKRIDWVTSNGEFRELGLLLITDQSDLVFWITK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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