当前解析结果
SmilChr03G001094| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001094 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001094 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001094 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 12638388 - 12639366 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018347 |
|---|---|
| GeneID | 131018347 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018347 |
| 原始查询 | LOC131018347 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os08g0315200- identity=34.2; qcov=0.585; evalue=5.88e-15; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018347 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057803058.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057803058.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057803058.1 |
| 4 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.20000 | XP_057803058.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057803058.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:12638403 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B103,C85 |
Chr3:12638403 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B103,C85 |
Chr3:12638405 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 15 | B103,B124,B125,B132,B137,B16,B17,B39,B65,B77,B87,C18,C29,C37,C63 |
Chr3:12638409 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr3:12638411 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C2 |
Chr3:12638411 |
CT |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr3:12638439 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A23,B103,B108 |
Chr3:12638445 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr3:12638465 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A13,B136 |
Chr3:12638480 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
Chr3:12638485 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C36 |
Chr3:12638529 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B38,B43 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。