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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001110`

染色体: Chr03 坐标: 12794924-12795595 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001110`
名称	SmilChr03G001110
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12794924 - 12795595 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018356`
GeneID	`131018356`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018356`
原始查询	`LOC131018356`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 4
产物	probable disease resistance RPP8-like protein 4
Arabidopsis	`AT1G58400` (AT1G58400) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842209] identity=29.7; qcov=1.04; evalue=1e-13; confidence=low
Rice	`Os09g0517200` - identity=33.7; qcov=0.731; evalue=7.35e-14; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018356

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057803069.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803069.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803069.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803069.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803069.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12794936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B108,C15
`Chr3:12794937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr3:12794943`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	22	A2,A3,B100,B103,B11,B119,B126,B13,B138,B17,B20,B32,B33,B38,B39,B5,B54,B93,C14,C19,C49,C53
`Chr3:12794951`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	22	A2,A3,B100,B103,B11,B119,B126,B13,B138,B17,B20,B32,B33,B38,B39,B5,B54,B93,C14,C19,C49,C53
`Chr3:12794958`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B108,C15
`Chr3:12794958`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B108,C15
`Chr3:12794968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,B83,C32,C68
`Chr3:12794977`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B108,C15
`Chr3:12794977`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B108,C15
`Chr3:12795011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B2,C15
`Chr3:12795019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:12795028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803069.1

223 aa

112

223

LRR_14

PF23598 LRR_14 16-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803069.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	16	212	1.7e-19	70.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947086.1
ATGGACAAGCTTCGTTACTTCAGCGCACATTTTGCCGTTGGACTGACGAACATAACCACGTGGAAAAATATTGAGTGTTTGAGACACGTAAGCCACGAATATTGGATGAAGTGCAGATCAACTCTAACGAGTAGTTGCAATCTTCGTGAATTAGGCATACGTTTTTATGATCCGATAGAGCATCAAGGGTTGATCAAAGTGAGAGCGTCGTTGGAGAAGTTGCAGAATCTTATCATACTTCACTTAACAATGTCTTTGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018356
ATGGACAAGCTTCGTTACTTCAGCGCACATTTTGCCGTTGGACTGACGAACATAACCACGTGGAAAAATATTGAGTGTTTGAGACACGTAAGCCACGAATATTGGATGAAGTGCAGATCAACTCTAACGAGTAGTTGCAATCTTCGTGAATTAGGCATACGTTTTTATGATCCGATAGAGCATCAAGGGTTGATCAAAGTGAGAGCGTCGTTGGAGAAGTTGCAGAATCTTATCATACTTCACTTAACAATGTCTTTGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803069.1
MDKLRYFSAHFAVGLTNITTWKNIECLRHVSHEYWMKCRSTLTSSCNLRELGIRFYDPIEHQGLIKVRASLEKLQNLIILHLTMSLYCVTDLAIAVPQLTNLTKLKLKGKMPKCPTASMFPPNLSHLTLIGSELHDDPMAELGKLPKLLFLKIQNNGYCSETMVVLCHGFPCLESLSFGNLHGLKGVFIEEGGMPKLKHLRIHDCFNLKTWNLPQHINIYVIE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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