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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001124`

染色体: Chr03 坐标: 12934568-12937249 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001124`
名称	SmilChr03G001124
描述	putative disease resistance protein At1g50180
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12934568 - 12937249 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018360`
GeneID	`131018360`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018360`
原始查询	`LOC131018360`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein At1g50180
产物	putative disease resistance protein At1g50180
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=35.5; qcov=0.539; evalue=8.65e-77; confidence=medium
Rice	`Os07g0186500` - identity=29.7; qcov=0.731; evalue=5.91e-74; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018360

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057803073.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803073.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803073.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803073.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803073.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12934675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,D11
`Chr3:12934694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B17,B26,B9,C78
`Chr3:12934694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B26,B9,C78
`Chr3:12934802`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B101,B40,C21,C4,C58,C8
`Chr3:12934810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,D11
`Chr3:12934845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr3:12934847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr3:12934851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C38
`Chr3:12934888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:12934938`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A14,B1,B138,C68,C73,D1,D3
`Chr3:12934942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B60,C17,C25,C55
`Chr3:12934944`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	22	A10,A16,A25,B111,B113,B121,B27,B32,B33,B42,B51,B56,B66,B73,B78,B83,C29,C41,C48,C52,C6,C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803073.1

893 aa

446

893

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 281-446 aa PF23559 WHD_DRP 529-599 aa PF23598 LRR_14 653-871 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803073.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	281	446	1e-41	143.1	NB-ARC domain
`XP_057803073.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	529	599	1.2e-21	77.2	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057803073.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	653	871	1.5e-14	54.2	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947090.1
ATGGCTTATGCTTCTCTCGTCTCCCTTGAAAACACCATAGATCGATTCCTGAATCATAATCCATTTTCCATATCTGTTGAAGAAAACCAACAAATTGCATCTCTCCTCGAGTATGTTACTCCCATTCGAGACTTTCTTGAAGAATTTCCAGACGAATCCCAGAGTTTGGAAGAGCAAATGAGGGAACTGGCAAATGCAGCAGAAGATATTCTAGAATATCTTGTGTTGGAGAAGGTTTTTTTGCCTTGTGATGATGACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018360
ATGGCTTATGCTTCTCTCGTCTCCCTTGAAAACACCATAGATCGATTCCTGAATCATAATCCATTTTCCATATCTGTTGAAGAAAACCAACAAATTGCATCTCTCCTCGAGTATGTTACTCCCATTCGAGACTTTCTTGAAGAATTTCCAGACGAATCCCAGAGTTTGGAAGAGCAAATGAGGGAACTGGCAAATGCAGCAGAAGATATTCTAGAATATCTTGTGTTGGAGAAGGTTTTTTTGCCTTGTGATGATGACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803073.1
MAYASLVSLENTIDRFLNHNPFSISVEENQQIASLLEYVTPIRDFLEEFPDESQSLEEQMRELANAAEDILEYLVLEKVFLPCDDDSESHHPSGRNHKLHLKKVIEQTCLKLEKVKEEFPEDFPDESKANSLEARIREAGDICEFFEWVETHRRFREKWRFLPAEFAKFKFKSKLQFIHHLNKTRNEIDSIMKEVMAIKNNASSSTLAPVDDIVGFNEDDGDESKCHRSARHELQLEKVIEEIASLAAKVKNIKDSSTSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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