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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001156`

染色体: Chr03 坐标: 13343876-13345303 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001156`
名称	SmilChr03G001156
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	13343876 - 13345303 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018378`
GeneID	`131018378`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018378`
原始查询	`LOC131018378`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`AT3G50950` (ZAR1) HOPZ-ACTIVATED RESISTANCE 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824259] identity=24.8; qcov=0.907; evalue=2.17e-13; confidence=weak
Rice	`Os10g0163040` - identity=26.1; qcov=0.467; evalue=1.76e-14; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018378

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803089.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803089.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803089.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803089.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803089.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:13343877`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C85
`Chr3:13343877`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C85
`Chr3:13343880`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B17
`Chr3:13343880`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B17
`Chr3:13343907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B85,D9
`Chr3:13343925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C45
`Chr3:13343929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr3:13343934`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B16,B72
`Chr3:13343934`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B16,B72
`Chr3:13343937`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C85
`Chr3:13343937`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C85
`Chr3:13343987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803089.1

475 aa

238

475

WHD_DRP

PF23559 WHD_DRP 3-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803089.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	3	74	8e-16	58.6	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947106.1
ATGGGAGTGTTTGAGGAGGATGATTCGGTTAAAGTCTCAACACTCGTGAAGCTATGGGTTTCTGAAGGATTTTTAAAACCCATGAATGGCAAAAGTTTGGAAACTATTGCCATAGAGTTCTTACAGGACTTGGTTGATAGAAATCTCATTTTAGTTGATAAAGTGGGTCATACAGGAAACATAAAATTTGTCAAAATTCATGATCTGTTGAGGGATTTATGCTTGAACCAGAGCAAGAAAGATGGGTTCTATCATGTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018378
ATGGGAGTGTTTGAGGAGGATGATTCGGTTAAAGTCTCAACACTCGTGAAGCTATGGGTTTCTGAAGGATTTTTAAAACCCATGAATGGCAAAAGTTTGGAAACTATTGCCATAGAGTTCTTACAGGACTTGGTTGATAGAAATCTCATTTTAGTTGATAAAGTGGGTCATACAGGAAACATAAAATTTGTCAAAATTCATGATCTGTTGAGGGATTTATGCTTGAACCAGAGCAAGAAAGATGGGTTCTATCATGTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803089.1
MGVFEEDDSVKVSTLVKLWVSEGFLKPMNGKSLETIAIEFLQDLVDRNLILVDKVGHTGNIKFVKIHDLLRDLCLNQSKKDGFYHVIGQSSPRGISSQHRVVIPRNTPKKKVLDDLQSMPHARSIISEYGNVPRIKNSGLLRTLHAYKFHHYFEDESLLKSLASQYVNLRHLVVEVGSMSSIFTSFTRLWNLHILIVCCWKEFTAPAEIWRMPQLRHIEMTERSFYLPEPSSDDVVVMENLLVLKSIANFKCSEEVVKRI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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