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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001177`

染色体: Chr03 坐标: 13525069-13537051 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001177`
名称	SmilChr03G001177
描述	putative disease resistance RPP13-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	13525069 - 13537051 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018389`
GeneID	`131018389`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018389`
原始查询	`LOC131018389`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance RPP13-like protein 3
产物	putative disease resistance RPP13-like protein 3
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=27.2; qcov=1.05; evalue=8.69e-44; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=25.9; qcov=1.14; evalue=1.76e-44; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018389

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057803100.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803100.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803100.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803100.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803100.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:13525098`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	48	A13,A18,A8,B105,B106,B11,B114,B12,B121,B133,B139,B19,B25,B29,B30,B34,B35,B52,B55,B61,B69,B72,B8,B86,B87,B88,B9,B90,B92,C11,C13,C29,C33,C36,C37,C38,C39,C41,C45,C51,C54,C65,C69,C70,C8,C80,C82,D10
`Chr3:13525109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B58,D10
`Chr3:13525117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B118,C27,C56,C82
`Chr3:13525127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,C56,D11,D3
`Chr3:13525146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B58,C8
`Chr3:13525152`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A10,B127,B128,B5,B63,C1,C54,C64,C66,C79
`Chr3:13525162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A18,A19,B124,B125,B25,B35,B4,B40,B42,B61,B62,B66,B76,B8,C15,C18,C20,C27,C35,C41,C48,C59,C60,C63,D3,D6,D9
`Chr3:13526527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C60
`Chr3:13526533`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	B12,B134,B140,B5,B55,B71,B75,B90,B99,C1,C24,D10,D8
`Chr3:13526553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A13,B105,B121,B20,B30,B53,B72,B8,C13,C29,C36
`Chr3:13526571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B102,B124,B136,B61,B85
`Chr3:13526571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B124,B136,B61,B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803100.1

667 aa

334

667

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 84-248 aa PF23559 WHD_DRP 284-348 aa PF23598 LRR_14 367-630 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803100.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	84	248	3.8e-21	76.1	NB-ARC domain
`XP_057803100.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	284	348	9.7e-19	67.9	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057803100.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	367	630	6.4e-29	101.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947117.1
ATGTTGAAGGTCCAGATTCCTGAGATTAGCAGCTCAATTTCGCTGGCGGATGATCAATCGCCGGGTGATTTCAGGATCAAGACGCGGAGCTCGCAACTCTCGACTCCATTCGGCGGCGGCAGCAGTGGCGAAAAGGATTTGGTGCGGCAGCTGCCTAGCGAGTCATCACGAAGATTGGCTCAACGGCAAAAAGACAAACAGGTGGTGGGCATGGAGAAAGACATAGAGCTGCTGCTTGAGAAGGCAATCTTGGATGGGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018389
ATGTTGAAGGTCCAGATTCCTGAGATTAGCAGCTCAATTTCGCTGGCGGATGATCAATCGCCGGGTGATTTCAGGATCAAGACGCGGAGCTCGCAACTCTCGACTCCATTCGGCGGCGGCAGCAGTGGCGAAAAGGATTTGGTGCGGCAGCTGCCTAGCGAGTCATCACGAAGATTGGCTCAACGGCAAAAAGACAAACAGGTGGTGGGCATGGAGAAAGACATAGAGCTGCTGCTTGAGAAGGCAATCTTGGATGGGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803100.1
MLKVQIPEISSSISLADDQSPGDFRIKTRSSQLSTPFGGGSSGEKDLVRQLPSESSRRLAQRQKDKQVVGMEKDIELLLEKAILDGGENLSISAIVGAGGTRKSTLARALYNHAAVADRFERRAWVVASKELSPRDIIKELYLLVKFGETDKFQLYISERLTVSELQQKLHKRLEGKRYFIVLDDMWDDAHQRLLQFYHTSFRWTGTSSRFLLTMHTPQPEDDYGYVHTMKCLDSDESWILFLNTVSDGKGVDQDLEDIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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