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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001260`

染色体: Chr03 坐标: 14541501-14542274 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001260`
名称	SmilChr03G001260
描述	uncharacterized SmilChr03G001260
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	14541501 - 14542274 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018422`
GeneID	`131018422`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018422`
原始查询	`LOC131018422`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0587600; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os03g0587600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0587600` - identity=50; qcov=0.148; evalue=4.74e-07; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018422

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803128.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803128.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057803128.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057803128.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803128.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:14541513`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr3:14541539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B72,C21
`Chr3:14541541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B92
`Chr3:14541563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C22,C41
`Chr3:14541601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B53,C33,C78
`Chr3:14541632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,B75,C19
`Chr3:14541648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C74,C87
`Chr3:14541650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C69
`Chr3:14541656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,A8,B15,B16
`Chr3:14541673`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A14,B118,B124,B22,B51,B58,B64,B72,B73,B84,C25,C26,C79
`Chr3:14541752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B30,C36
`Chr3:14541754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	101	A10,A13,A14,A15,A19,A2,A22,A5,A7,A8,A9,B1,B10,B103,B109,B110,B112,B114,B117,B119,B12,B130,B135,B137,B138,B14,B140,B15,B16,B17,B2,B20,B21,B23,B26,B27,B30,B38,B39,B41,B46,B48,B49,B51,B52,B58,B59,B60,B61,B62,B64,B66,B67,B70,B8,B80,B81,B84,B85,B86,B88,B9,B90,B91,B93,C12,C16,C17,C20,C22,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C36,C38,C39,C4,C40,C42,C43,C44,C45,C5,C51,C55,C57,C58,C61,C66,C7,C79,C8,C80,C86,C9,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947145.1
ATGACTGTTGTTCTTCCTAAGGCTCGTTTTGAGTGGATGCATTTAAGAATGCATGATTTCAAAAGTGTGAGTGCTTATAATTCGGAATTGTTTCGAATTACTTCTAAATTGAAGCTATGTGGTGAAACAATCTCCGATGAAGATATGCTTGAGAAAACATTCTCAACTTTTCATGCTTCAAATGTGCTCTTACAACAACAATATAGAGAGCGGGGTTTCAAAAAGTACTCTGACCTTATATCTTGCTTATTAGTTGCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018422
ATGACTGTTGTTCTTCCTAAGGCTCGTTTTGAGTGGATGCATTTAAGAATGCATGATTTCAAAAGTGTGAGTGCTTATAATTCGGAATTGTTTCGAATTACTTCTAAATTGAAGCTATGTGGTGAAACAATCTCCGATGAAGATATGCTTGAGAAAACATTCTCAACTTTTCATGCTTCAAATGTGCTCTTACAACAACAATATAGAGAGCGGGGTTTCAAAAAGTACTCTGACCTTATATCTTGCTTATTAGTTGCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803128.1
MTVVLPKARFEWMHLRMHDFKSVSAYNSELFRITSKLKLCGETISDEDMLEKTFSTFHASNVLLQQQYRERGFKKYSDLISCLLVAEQNNELLMKNHELKPTGSTALPEANATIKQEYDRGRRNQRGRGRGRGRDRGRGRGHGRGRGYGRGNVDHATSSNKRHKPSKDHNSSKWEDTCHKCGMTGHWSRTCRTAKHLVDLYQKSIKENVKNETNVLDFDGTIDTTHLDVSDFFADPNGNIDGMIGGGVLEDNKADLA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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