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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001262`

染色体: Chr03 坐标: 14572958-14574812 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001262`
名称	SmilChr03G001262
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	14572958 - 14574812 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018423`
GeneID	`131018423`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018423`
原始查询	`LOC131018423`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=27.7; qcov=0.747; evalue=1.58e-45; confidence=low
Rice	`Os11g0681300` - identity=28.7; qcov=0.749; evalue=4.55e-44; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018423

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803129.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803129.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803129.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803129.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803129.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:14572980`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B16,B18,B60,C11,C50,C69
`Chr3:14572985`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	235	A1,A10,A11,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B75,B77,B78,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C10,C11,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C58,C6,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr3:14572995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C50
`Chr3:14572999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B140,C27
`Chr3:14573005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,D7
`Chr3:14573040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B77,B9,B99,C22,C26
`Chr3:14573080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	231	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B13,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B31,B33,B34,B35,B4,B40,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B51,B53,B54,B55,B56,B59,B6,B60,B61,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr3:14573127`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	75	A10,A11,A18,A2,A4,A5,A6,B1,B10,B103,B107,B110,B111,B112,B115,B118,B119,B120,B127,B128,B130,B134,B135,B138,B15,B19,B20,B22,B28,B34,B46,B51,B53,B54,B7,B73,B77,B78,B83,B87,B88,B91,B97,B98,C10,C18,C2,C20,C22,C24,C27,C28,C31,C33,C36,C37,C38,C39,C41,C43,C48,C56,C57,C59,C6,C60,C70,C72,C76,C77,C78,C79,C8,C80,D6
`Chr3:14573150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B132,B85,C33
`Chr3:14573151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:14573153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C85
`Chr3:14573155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803129.1

517 aa

258

517

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 101-222 aa PF10551 MULE 140-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803129.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	101	222	2.8e-11	44.2	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057803129.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	140	231	1.1e-24	87.3	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947146.1
ATGGGAAGTTGCTACAAGATTACTGATTTTTGTGAGGGTCATACACATTCCATGGTACCTTTACCAGCAAGAGACCTGATGCAAAGTAACAGGAATCTTGATGAATTTCAACAAAGGTTCATAATTTATGGTCTAAAGGCTAACATTGGTCCAATGAGTTCATTCCGTATGTTCAGAGAGATTATGGGCAGTTACGATCGTATTGGATGCAAAGGTAATGATTTCAAGAATTTTGCCAGGGACTTGAAAGTGCATTCTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018423
ATGGGAAGTTGCTACAAGATTACTGATTTTTGTGAGGGTCATACACATTCCATGGTACCTTTACCAGCAAGAGACCTGATGCAAAGTAACAGGAATCTTGATGAATTTCAACAAAGGTTCATAATTTATGGTCTAAAGGCTAACATTGGTCCAATGAGTTCATTCCGTATGTTCAGAGAGATTATGGGCAGTTACGATCGTATTGGATGCAAAGGTAATGATTTCAAGAATTTTGCCAGGGACTTGAAAGTGCATTCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803129.1
MGSCYKITDFCEGHTHSMVPLPARDLMQSNRNLDEFQQRFIIYGLKANIGPMSSFRMFREIMGSYDRIGCKGNDFKNFARDLKVHSKGSNAHMLLESFTNKQDLGNGFRFFHDVDEENKLCRIIWADQTSIKNFSLFGEVVSYDATYNTNKHKLIFTPFTGKDNHGKCVSFGAALISHEDTESYSWVLDRFVQIMGHAPQIIITDQDLGLKGAVASCWKETRHMFCMWHINIKVAEKLPQRLREDTSFKSTYDSIVLTDN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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