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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001270`

染色体: Chr03 坐标: 14770163-14771743 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001270`
名称	SmilChr03G001270
描述	uncharacterized SmilChr03G001270
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	14770163 - 14771743 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018427`
GeneID	`131018427`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018427`
原始查询	`LOC131018427`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=24.1; qcov=0.998; evalue=1.05e-30; confidence=weak
Rice	`Os09g0268600` - identity=27.9; qcov=0.69; evalue=2.06e-33; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018427

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803131.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803131.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803131.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803131.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803131.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:14770168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr3:14770179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr3:14770201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B7
`Chr3:14770223`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A10,A13,A20,B24,B56,B6,B61,B62,B72,C14,C36,C39,C64,C66,C71,C8,D9
`Chr3:14770237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	88	A11,A13,A15,A16,A19,A25,B100,B101,B102,B103,B106,B110,B111,B119,B121,B123,B124,B125,B13,B130,B132,B136,B140,B2,B21,B27,B29,B3,B32,B38,B4,B41,B44,B45,B46,B47,B50,B51,B52,B57,B59,B61,B64,B66,B69,B72,B73,B76,B77,B79,B84,B85,B86,B9,B92,B97,B99,C10,C15,C16,C2,C22,C25,C26,C30,C33,C35,C37,C38,C41,C43,C45,C47,C5,C50,C56,C58,C61,C62,C7,C71,C72,C74,C76,C80,C84,C86,D11
`Chr3:14770241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C45
`Chr3:14770246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	77	A1,A22,A25,A3,A4,A5,B11,B112,B114,B115,B117,B120,B125,B126,B128,B129,B13,B131,B133,B137,B138,B139,B15,B17,B2,B20,B24,B26,B3,B30,B34,B35,B40,B45,B50,B54,B58,B61,B63,B65,B70,B73,B76,B77,B81,B83,B88,B90,B91,B94,B95,C2,C20,C28,C29,C3,C30,C32,C41,C45,C47,C48,C49,C5,C51,C57,C60,C63,C64,C66,C68,C78,C8,C87,D11,D5,D6
`Chr3:14770248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:14770295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B69,B9,C22,C26,C47
`Chr3:14770312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B26
`Chr3:14770319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B110,B20,D11
`Chr3:14770327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	88	A1,A10,A13,A18,A20,A21,A22,A23,A4,A7,B105,B107,B112,B119,B121,B125,B126,B13,B133,B134,B15,B2,B23,B26,B27,B29,B33,B37,B42,B46,B53,B55,B56,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B76,B78,B80,B83,B88,B91,C13,C14,C15,C19,C2,C20,C21,C25,C26,C29,C30,C32,C36,C38,C43,C5,C53,C55,C57,C6,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C68,C7,C71,C76,C77,C8,C80,C83,C85,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803131.1

462 aa

231

462

SWIM

PF04434 SWIM 290-320 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803131.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	290	320	1e-06	28.9	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947148.1
ATGCAGCGCTTATTCGGGATTGAGATCAATTACAGCTTTGCTCTCCGAGCAAGAAACATCGCGATTAAGATGATGTCCGGTGATTTTGAGAACTCTTATCAGATGCTCCCGTCATATTTGTATATGCTGAGATCGAGTAATCTCGGCACGTTATATGACCTTGAGATGAAGTCTGATGGCGAGTTTCATCATATGTTTGTTACTCTTGGACAGAGCGTGGCTGCCTTTGAGAGTCACTTGAGACCGATCATCGTCGTAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018427
ATGCAGCGCTTATTCGGGATTGAGATCAATTACAGCTTTGCTCTCCGAGCAAGAAACATCGCGATTAAGATGATGTCCGGTGATTTTGAGAACTCTTATCAGATGCTCCCGTCATATTTGTATATGCTGAGATCGAGTAATCTCGGCACGTTATATGACCTTGAGATGAAGTCTGATGGCGAGTTTCATCATATGTTTGTTACTCTTGGACAGAGCGTGGCTGCCTTTGAGAGTCACTTGAGACCGATCATCGTCGTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803131.1
MQRLFGIEINYSFALRARNIAIKMMSGDFENSYQMLPSYLYMLRSSNLGTLYDLEMKSDGEFHHMFVTLGQSVAAFESHLRPIIVVDGTHLKGRKRGILFVAVTKDGNEGVFPLHKSIRNAVECLYPNVPHVLCYYHLQKNLAHYGLHVATVFKAATYSYRSDDFHRNFSALEVLKVNAHTRLDINGVEPWARSKCPVRRTSFMMSNAAETMNNRLLWARRLPVASLIESYRAIMEKWFDARCHSAASRSHELTEVVAAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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