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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001319`

染色体: Chr03 坐标: 15458438-15459753 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001319`
名称	SmilChr03G001319
描述	uncharacterized SmilChr03G001319
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	15458438 - 15459753 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018438`
GeneID	`131018438`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018438`
原始查询	`LOC131018438`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G19260` (AT1G19260) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509] identity=42.2; qcov=0.822; evalue=8.7e-75; confidence=medium
Rice	`Os02g0301400` - identity=39.9; qcov=0.582; evalue=6.15e-48; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371); PF27073 (FAM200-ZBED5_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018438

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803144.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803144.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803144.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803144.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803144.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:15458666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B2,B99,C56
`Chr3:15458985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B36,C21
`Chr3:15459007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:15459070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C67
`Chr3:15459070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr3:15459095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,B91,D6,D7
`Chr3:15459197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr3:15459201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr3:15459219`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A10,A18,B48,B50,C60,C74,C83,D5
`Chr3:15459534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr3:15459583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,B59,C13
`Chr3:15459586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803144.1

366 aa

183

366

DUF4371

FAM200-ZBED5_RNase-like

PF14291 DUF4371 104-330 aa PF27073 FAM200-ZBED5_RNase-like 220-334 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803144.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	104	330	4.5e-75	253.0	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057803144.1`	Pfam	`PF27073`	FAM200-ZBED5_RNase-like	Domain	220	334	5e-11	43.3	FAM200/ZBED5 RNase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947161.1
ATGGATAAGAGAAAGAGAGGAATTGAATCGTACTTCCAAAAACAAAGTGCCCGCATAGATGTTGGTGGTTCCCGTTCATCTAATCCTGAGGTTCCAGTTCCAACTGTAGATGCAATTGAAAAAAGTCCACAACAACTACAAGCAGAAGTCCCTTGTCCAGAACTTCCCCCGCTTAAAATCACAAAGATTGGCAATGAATCTGATGATATTCATGTAGAACGTGATCCAGAATATTCACCTTCAGAAAATGCCGTATTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018438
ATGGATAAGAGAAAGAGAGGAATTGAATCGTACTTCCAAAAACAAAGTGCCCGCATAGATGTTGGTGGTTCCCGTTCATCTAATCCTGAGGTTCCAGTTCCAACTGTAGATGCAATTGAAAAAAGTCCACAACAACTACAAGCAGAAGTCCCTTGTCCAGAACTTCCCCCGCTTAAAATCACAAAGATTGGCAATGAATCTGATGATATTCATGTAGAACGTGATCCAGAATATTCACCTTCAGAAAATGCCGTATTTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803144.1
MDKRKRGIESYFQKQSARIDVGGSRSSNPEVPVPTVDAIEKSPQQLQAEVPCPELPPLKITKIGNESDDIHVERDPEYSPSENAVFCFPCFLFAKIDAKYGGNAFVVGGFRTWKRVNNGKKCAFLIHVGSAPNSAHKHIGRVVDKQTSDLVRKNRLRVKASIDVAKLCALLGIAFRGRDESPDSRNRGNFLEILKYTASYNEEVASVVLENAPKNASYTSHSIQKEILSVYASKIQKFIRAEIGDEKFCIIVDESRDESK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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