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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001339`

染色体: Chr03 坐标: 15628856-15634931 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001339`
名称	SmilChr03G001339
描述	uncharacterized SmilChr03G001339
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	15628856 - 15634931 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018443`
GeneID	`131018443`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018443`
原始查询	`LOC131018443`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OS-CAD; symbol=OS-CAD; hit=Os03g0581100; species=rice; confidence=weak
产物	OS-CAD; symbol=OS-CAD; hit=Os03g0581100; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0581100` (OS-CAD) - identity=29.9; qcov=0.131; evalue=2.1e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF20167 (Retrotransp-rel)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018443

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803148.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057803148.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803148.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803148.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803148.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:15628859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C7
`Chr3:15628860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr3:15628898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C43
`Chr3:15628908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B140,B41,B94,D2
`Chr3:15628928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:15628929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C33
`Chr3:15628953`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	48	A19,A2,A7,B1,B105,B108,B109,B112,B117,B122,B123,B13,B18,B26,B36,B48,B51,B62,B7,B83,B84,B87,B95,B99,C12,C13,C14,C16,C22,C23,C26,C34,C39,C53,C56,C61,C62,C64,C66,C67,C70,C78,C81,D10,D2,D6,D7,D8
`Chr3:15628972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B128,C55
`Chr3:15628979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B26,B96
`Chr3:15628985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B140
`Chr3:15628995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B75,D11
`Chr3:15628997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,B62,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803148.1

740 aa

370

740

Retrotransp-rel

PF20167 Retrotransp-rel 348-510 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803148.1`	Pfam	`PF20167`	Retrotransp-rel	Domain	348	510	1e-23	84.9	Putative plant retrotransposon-related domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947165.1
ATGGCCGAATCAACCGACAAACCCTCGTCTTCTCAAACTCCGGTGGAAGTCGCAGGAGGATCTTTTCCTCTAGCTCCTTCTCCAAAAGGCTCTCCGAAGGGAAGCACCACTGAATCGTCTGTAGGGGCTGATGTTGATCCTGTCTCTCTGCAAATGGTAGAAATTCCCATCAACCCTGAGCCGATCTCCACTGTTCCTCCCCTTGAGAATGTTCATTCAAAAATGGCGCCTGATTCCTCTGCGAAAGTTGACGAAAATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018443
ATGGCCGAATCAACCGACAAACCCTCGTCTTCTCAAACTCCGGTGGAAGTCGCAGGAGGATCTTTTCCTCTAGCTCCTTCTCCAAAAGGCTCTCCGAAGGGAAGCACCACTGAATCGTCTGTAGGGGCTGATGTTGATCCTGTCTCTCTGCAAATGGTAGAAATTCCCATCAACCCTGAGCCGATCTCCACTGTTCCTCCCCTTGAGAATGTTCATTCAAAAATGGCGCCTGATTCCTCTGCGAAAGTTGACGAAAATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803148.1
MAESTDKPSSSQTPVEVAGGSFPLAPSPKGSPKGSTTESSVGADVDPVSLQMVEIPINPEPISTVPPLENVHSKMAPDSSAKVDENLTKGKTSLPNPTVHATSEKSTGLPAVGVTQHQTSLPTPSGESIPSSKEESAYASPDTSLEKIGEIAKEALLDLASQPGSDVDKASAVAEEECVAGDIPTSMDVDDSEKIPDVGQDVDPEESTDVIDVDTFVPDKKSRKRKAGVASLRRSSSREDSDVGPTSQPPVLKPKVEHSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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