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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001352`

染色体: Chr03 坐标: 15780299-15782533 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001352`
名称	SmilChr03G001352
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	15780299 - 15782533 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018449`
GeneID	`131018449`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018449`
原始查询	`LOC131018449`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT3G50950` (ZAR1) HOPZ-ACTIVATED RESISTANCE 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824259] identity=30.7; qcov=0.819; evalue=5.76e-59; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=34.5; qcov=0.483; evalue=9.88e-67; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018449

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057803153.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803153.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803153.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803153.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803153.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:15780380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B133,B42,B43
`Chr3:15780498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B131,C24
`Chr3:15780520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B131
`Chr3:15780541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B131
`Chr3:15780580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B131
`Chr3:15780602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,C27
`Chr3:15780617`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A13,B89,B94,C13,C16,C4,D5
`Chr3:15780712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr3:15780740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr3:15780764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr3:15780766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr3:15780850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803153.1

744 aa

372

744

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 175-342 aa PF23559 WHD_DRP 429-500 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803153.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	175	342	1e-43	149.7	NB-ARC domain
`XP_057803153.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	429	500	1.9e-15	57.3	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947170.1
ATGGCGGCCTACGCAGCCTTGGTTTCTCTTATGCATATCATAGACGACCTCGAGCGCCACCATTCCCCTCCGATTTCTCTCGACAAACAACAACTTGAATCCCTCACTGAAAATGTCACGTTCTTGCAGGAGTTTCTCGTAGCTTATAACTCCCCTGTTTCCGACGAAGCAGATCCATTGGAGATGCGTATTGCAGATGCAGCTTATGCAGCTGAAGACGCCATCGAATCTCATATCGTGGCCAAGATTCAGCTGAGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018449
ATGGCGGCCTACGCAGCCTTGGTTTCTCTTATGCATATCATAGACGACCTCGAGCGCCACCATTCCCCTCCGATTTCTCTCGACAAACAACAACTTGAATCCCTCACTGAAAATGTCACGTTCTTGCAGGAGTTTCTCGTAGCTTATAACTCCCCTGTTTCCGACGAAGCAGATCCATTGGAGATGCGTATTGCAGATGCAGCTTATGCAGCTGAAGACGCCATCGAATCTCATATCGTGGCCAAGATTCAGCTGAGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803153.1
MAAYAALVSLMHIIDDLERHHSPPISLDKQQLESLTENVTFLQEFLVAYNSPVSDEADPLEMRIADAAYAAEDAIESHIVAKIQLSRSTEADNSPVSDEADPEDPNNVSSNHDDDEEMNLFQDVQNVIYEMDQIKGLAMQTNTEKVVLHDKRRSFVSASSSTGKNSSGMVVCSEGVVNGILEKLVSDQRERQVIPITGMGGIGKTTLAKTVYSKKIIEQRFDVCAWATISQQYNTREILCELVSQATNKSKEQLSEKSED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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