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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001391`

染色体: Chr03 坐标: 16499300-16501456 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001391`
名称	SmilChr03G001391
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	16499300 - 16501456 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018462`
GeneID	`131018462`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018462`
原始查询	`LOC131018462`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=27.3; qcov=1.06; evalue=9.51e-67; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=28.1; qcov=0.987; evalue=1.01e-66; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018462

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057803164.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803164.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803164.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803164.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803164.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:16499317`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B11,B138,B20,B21,B42,B43,B6,B63,B98,C49,C53,D2
`Chr3:16499323`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	B11,B138,B20,B21,B42,B43,B6,B63,B98,C16,C49,C53,C65,D2
`Chr3:16499446`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A23,B108,B11,B118,B20,B42,B43,B6,B63,B69,B71,B98,C16,C49,C56,C65,C66,D2
`Chr3:16499449`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B108,B118,B71,C56,C66
`Chr3:16499449`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B108,B118,B71,C56,C66
`Chr3:16499481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,B43
`Chr3:16499486`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B104,B14,B47,B78,B89,C18,C29,C33,C87
`Chr3:16499489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr3:16499552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr3:16499602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr3:16499702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C85
`Chr3:16499705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803164.1

718 aa

359

718

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 28-196 aa PF23559 WHD_DRP 286-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803164.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	28	196	6.2e-39	134.0	NB-ARC domain
`XP_057803164.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	286	356	4.1e-20	72.3	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947181.1
ATGCGATCGAATGATTCTCCAGCTGCTGCTCCAACATCAACACTTGCACCGACGGGAAGAATTGATGCGGTTGGTCTTGATCGCGATGTTGAGGCAATACTCAGTCGCCTCCGTCGAGATGCTGACGAACTCCAAATCATTCCGATAGCTGGCGCAGGAGGAATCGGTAAAACAACTCTGGCTCGAAATGTTTATCATGATCCATATCTCATAGACAAGTTTGACATTCGTGCTTGGGTTACAGTATCTCAGGATTATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018462
ATGCGATCGAATGATTCTCCAGCTGCTGCTCCAACATCAACACTTGCACCGACGGGAAGAATTGATGCGGTTGGTCTTGATCGCGATGTTGAGGCAATACTCAGTCGCCTCCGTCGAGATGCTGACGAACTCCAAATCATTCCGATAGCTGGCGCAGGAGGAATCGGTAAAACAACTCTGGCTCGAAATGTTTATCATGATCCATATCTCATAGACAAGTTTGACATTCGTGCTTGGGTTACAGTATCTCAGGATTATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803164.1
MRSNDSPAAAPTSTLAPTGRIDAVGLDRDVEAILSRLRRDADELQIIPIAGAGGIGKTTLARNVYHDPYLIDKFDIRAWVTVSQDYNFGNIFKNLLVSMKVFVKEDITGLSKEEMALKVHQTLTDRMYLIVIDDMWSTKAWDEIRSYFPNNSNRSRIILATRLKDVAAYVDSSEKFHEMQYLDDVQSLNLLKKELCKGECRLPMLEAMENIATKIARSCGGLPLAIVVTAGLLSEVSETEADWEQIADNINLVITADEEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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