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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001433`

染色体: Chr03 坐标: 17015322-17019023 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001433`
名称	SmilChr03G001433
描述	uncharacterized SmilChr03G001433
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	17015322 - 17019023 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018471`
GeneID	`131018471`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018471`
原始查询	`LOC131018471`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=24.4; qcov=0.411; evalue=4.2e-24; confidence=weak
Rice	`Os03g0643433` - identity=30.6; qcov=0.593; evalue=1.97e-84; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018471

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803173.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803173.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803173.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803173.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803173.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:17015326`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A6,B118,B123,B21,B30,B50,B76,B99,C47,C48,C7
`Chr3:17015327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,B94
`Chr3:17015364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,B94
`Chr3:17015383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,B94
`Chr3:17015433`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,B94
`Chr3:17015449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B55,B83,B94
`Chr3:17015476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A11,A24,B20,B35,B46,B53,B66,B94,C33,C36,C42,C58
`Chr3:17015478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C36
`Chr3:17015481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B78,B83,C51
`Chr3:17015512`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	B102,B123,B13,B24,B57,C2,C26,C32,C44,C5,C68,C75,C8,C80,C82,C84
`Chr3:17015573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr3:17015579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B12,B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803173.1

1097 aa

548

1097

RVT_1

zf-RVT

PF00078 RVT_1 433-692 aa PF13966 zf-RVT 906-999 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803173.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	433	692	7.9e-36	124.5	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057803173.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	906	999	1.1e-16	62.0	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947190.1
ATGAAGATCTTCTCCTATAATGTTAGAGGTCTTGGGAGTAAGGTTAAGAAGAGAGAAGTTCGGGAAATCATTCAGAATCAGAACATCGATTTTTGCATGATCCAGGAAACTAAAATGGAGTCTTTCGGTGATTATGACAACAAAATTATTTGGGGTTCGGATAACGTGGGCGGAGTCTCTCGTAAAGCCGAAGGGAGATCAGGGGGAATCCTCACTCTTTGGAATCCTATCAATTTTTCTTGCTCAAGTTCTTGGGATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018471
ATGAAGATCTTCTCCTATAATGTTAGAGGTCTTGGGAGTAAGGTTAAGAAGAGAGAAGTTCGGGAAATCATTCAGAATCAGAACATCGATTTTTGCATGATCCAGGAAACTAAAATGGAGTCTTTCGGTGATTATGACAACAAAATTATTTGGGGTTCGGATAACGTGGGCGGAGTCTCTCGTAAAGCCGAAGGGAGATCAGGGGGAATCCTCACTCTTTGGAATCCTATCAATTTTTCTTGCTCAAGTTCTTGGGATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803173.1
MKIFSYNVRGLGSKVKKREVREIIQNQNIDFCMIQETKMESFGDYDNKIIWGSDNVGGVSRKAEGRSGGILTLWNPINFSCSSSWDIPGALFVNGRWNPGKIDICLINVYAPQSLADRWFCGIKLQMKELGEELSFRQEIFRASTLSSEERTLKTSVFKVENTLGTNLKGCWQEVSKERYRTTVRSLLTQKRLIGGQKLSGWSSFVFKEKMKRLKTDLKSWNRVSFGSLEENISRLKSVLQEWDIADETSGLNEEEILQR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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