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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001439`

染色体: Chr03 坐标: 17098015-17099406 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001439`
名称	SmilChr03G001439
描述	uncharacterized SmilChr03G001439
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	17098015 - 17099406 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018474`
GeneID	`131018474`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018474`
原始查询	`LOC131018474`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018474

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803176.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803176.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803176.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057803176.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803176.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:17098127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B69,C44,C58,C85
`Chr3:17098305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C73
`Chr3:17098369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C62
`Chr3:17098416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,D11
`Chr3:17098424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,D11
`Chr3:17098432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B99,D11
`Chr3:17098435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,D11
`Chr3:17098438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,D11
`Chr3:17098461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,D11
`Chr3:17098501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,B29,C13,C40,C41
`Chr3:17098507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr3:17098544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A4,B130,B20,B84,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803176.1

463 aa

232

463

RRM_1

PF00076 RRM_1 54-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803176.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	54	120	3e-07	30.9	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947193.1
ATGGGAGAGGAGGTCTGGAGGGAGGTGAGGAGACGAGGGGAAGTGAGGAACGGAGCCGATGGGATGGTGAAGAAGCAGCTGAACCAAAAGACTCAAAGGTTTTCGAAACTTTGGAAAGCAAGAGACGAGAATGAAGCACAAAAAGTTACATTCTTTTTCAACAACATTCCAGAAGAATGTAGCTTTGATTTTTTGAGGAGAAAGTTCGGTTCCGTGCGAGAACCGACAGACATCTTTTGTCCAAGAAAGAGAGACAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018474
ATGGGAGAGGAGGTCTGGAGGGAGGTGAGGAGACGAGGGGAAGTGAGGAACGGAGCCGATGGGATGGTGAAGAAGCAGCTGAACCAAAAGACTCAAAGGTTTTCGAAACTTTGGAAAGCAAGAGACGAGAATGAAGCACAAAAAGTTACATTCTTTTTCAACAACATTCCAGAAGAATGTAGCTTTGATTTTTTGAGGAGAAAGTTCGGTTCCGTGCGAGAACCGACAGACATCTTTTGTCCAAGAAAGAGAGACAAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803176.1
MGEEVWREVRRRGEVRNGADGMVKKQLNQKTQRFSKLWKARDENEAQKVTFFFNNIPEECSFDFLRRKFGSVREPTDIFCPRKRDKKGKPFGFVRFEDVEDRDGLLEQLNKLWIGSYKIRVFKPRFEREVKIQGSKGKGFKADAGRKTEKTKVVHAAKRMMGVSFKEVLTGSKEGESGPSDLLQFKTSDEETRWLDGAFTGFIKDEFLWEEINEEINSEIAGKLKVTTMGGNLVLIRSVCDAPTEKVLTEMDEWSEFWFQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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