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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001455`

染色体: Chr03 坐标: 17377904-17380060 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001455`
名称	SmilChr03G001455
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	17377904 - 17380060 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018477`
GeneID	`131018477`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018477`
原始查询	`LOC131018477`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=27.3; qcov=1.06; evalue=8.05e-67; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=27.4; qcov=1.01; evalue=1.22e-66; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018477

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057803178.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803178.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803178.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803178.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803178.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:17377937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr3:17378022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C65
`Chr3:17378053`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A4,B108,B113,B115,B19,B46,B48,B5,B52,B57,B71,B82,C13,C36,C37,C56,C64,C66,D4
`Chr3:17378067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B2,C65
`Chr3:17378090`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A1,B104,B14,B27,B47,B78,C17,C61,C87
`Chr3:17378099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr3:17378114`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A9,B111,B121,B22,B25,B97,C11,C16,C41,C84
`Chr3:17378133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B2,B20,C65
`Chr3:17378162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B30
`Chr3:17378193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr3:17378224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr3:17378227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803178.1

718 aa

359

718

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 28-196 aa PF23559 WHD_DRP 286-356 aa PF23598 LRR_14 405-688 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803178.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	28	196	3.4e-40	138.1	NB-ARC domain
`XP_057803178.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	286	356	3.8e-20	72.4	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057803178.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	405	688	5.9e-15	55.6	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947195.1
ATGCGATCGAATGATTCTCCAGCTGCTGCTCCAACATCAACACTTGCACCGACGGGAAGAATTGATGCGGTTGGTCTTGATCGCGATGTTGAGGCAATACTCAGTCGCCTCCGTCGAGATGCTGACGAACTCCAAATCATTCCGATAGCTGGCGCAGGAGGAATTGGTAAAACAACTCTGGCTCGAAATGTTTATCATGATCCATATCTCATAGACAAGTTTGACATTCGTGCTTGGGTTACAGTATCTCAGGATTATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018477
ATGCGATCGAATGATTCTCCAGCTGCTGCTCCAACATCAACACTTGCACCGACGGGAAGAATTGATGCGGTTGGTCTTGATCGCGATGTTGAGGCAATACTCAGTCGCCTCCGTCGAGATGCTGACGAACTCCAAATCATTCCGATAGCTGGCGCAGGAGGAATTGGTAAAACAACTCTGGCTCGAAATGTTTATCATGATCCATATCTCATAGACAAGTTTGACATTCGTGCTTGGGTTACAGTATCTCAGGATTATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803178.1
MRSNDSPAAAPTSTLAPTGRIDAVGLDRDVEAILSRLRRDADELQIIPIAGAGGIGKTTLARNVYHDPYLIDKFDIRAWVTVSQDYNFGNIFKNLLVSMKVFVKEDITGLSKEEMALKVHQTLMDRRYLIVIDDMWSTKVWDEIRSYFPNNSNRSRIILATRLKDVAAYVDSSEKFHEMQYLDDVQSLNLLKKELCKGECRLPMLEAMENIATKIARSCGGLPLAIVVTAGLLSEVSETEADWEQIADNINLVITADEEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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