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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001487`

染色体: Chr03 坐标: 17945438-17947540 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001487`
名称	SmilChr03G001487
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	17945438 - 17947540 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018485`
GeneID	`131018485`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018485`
原始查询	`LOC131018485`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=28.5; qcov=1.03; evalue=2.68e-69; confidence=low
Rice	`Os10g0183000` (OsLSR) - identity=29.2; qcov=1; evalue=3.62e-67; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018485

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057803184.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803184.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803184.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803184.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803184.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:17945502`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	B110,B111,B112,B131,B133,B28,B36,B47,B78,B8,B83,B95,C18,C25,C32,C33,C5,C59,C60,C61,C68
`Chr3:17945615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,C10,C74,D11
`Chr3:17945647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr3:17945652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr3:17945660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr3:17945665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr3:17945704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B110,B67
`Chr3:17945706`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A11,B110,B67
`Chr3:17945706`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A11,B110,B67
`Chr3:17945710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	99	A15,A16,A18,A19,A21,A23,A25,A3,A5,A7,B100,B102,B103,B107,B108,B109,B114,B117,B12,B121,B122,B124,B127,B128,B13,B130,B137,B139,B140,B15,B18,B2,B26,B29,B3,B31,B32,B37,B4,B40,B44,B45,B54,B55,B56,B61,B62,B66,B69,B75,B76,B8,B81,B82,B84,B85,B88,B89,B9,B90,B92,B94,B95,B97,B98,C11,C12,C13,C14,C16,C19,C29,C31,C32,C34,C36,C4,C40,C42,C43,C47,C49,C53,C55,C57,C60,C62,C63,C68,C69,C76,C77,C79,C8,C81,C85,C86,C9,D5
`Chr3:17945728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B106,B110,B67,C14
`Chr3:17945731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B106,B110,B67,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803184.1

700 aa

350

700

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 1-144 aa PF23559 WHD_DRP 228-298 aa PF23598 LRR_14 395-674 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803184.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	1	144	1.4e-34	119.9	NB-ARC domain
`XP_057803184.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	228	298	3.2e-19	69.5	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057803184.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	395	674	2.4e-16	60.2	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947201.1
ATGGGTGGCATCGGCAAAACTACTCTTGCCAGGAACGTTTATGGTGATCCATTAACAGTAGGCCATTTTGCGATTCGTGTTTGGGTTACAATATCACAAGATTACAGTGCACAGAGAATTCTTTCTAGTCTTCTGGAGTCCTTGAAAGAATACAACACAGGTGGATTGGGACAAAGTGACTATCAAAAAGTGCACAAAATTTTAATGGGCAGGAGATATTTAGTTGTGATGGATGATATGTGGAGTAGTGAGGCACGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018485
ATGGGTGGCATCGGCAAAACTACTCTTGCCAGGAACGTTTATGGTGATCCATTAACAGTAGGCCATTTTGCGATTCGTGTTTGGGTTACAATATCACAAGATTACAGTGCACAGAGAATTCTTTCTAGTCTTCTGGAGTCCTTGAAAGAATACAACACAGGTGGATTGGGACAAAGTGACTATCAAAAAGTGCACAAAATTTTAATGGGCAGGAGATATTTAGTTGTGATGGATGATATGTGGAGTAGTGAGGCACGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803184.1
MGGIGKTTLARNVYGDPLTVGHFAIRVWVTISQDYSAQRILSSLLESLKEYNTGGLGQSDYQKVHKILMGRRYLVVMDDMWSSEARDVVRWVFPDDGNGSRVVLTTRLYDVASYPDPSNRLHEMSLLNAEQSWNLFKHKVFADEECPSYLETIGKEIARSCKGLPLAVVVIAGLLSTVSEDPNSWQKIAEKVTSAQTAVHDQIEEILSLSYVELPQYLRPCFLYTASFPEDYQIHVVKLIRLWVAEGIVKYPSDSDSFEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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