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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001492`

染色体: Chr03 坐标: 18074022-18075038 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001492`
名称	SmilChr03G001492
描述	uncharacterized SmilChr03G001492
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	18074022 - 18075038 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018487`
GeneID	`131018487`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018487`
原始查询	`LOC131018487`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=40.3; qcov=0.248; evalue=3.77e-08; confidence=weak
Rice	`Os12g0292200` - identity=34.5; qcov=0.3; evalue=4.99e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018487

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803186.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803186.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803186.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803186.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803186.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:18074034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A13,A18,A25,B120,B126,B13,B14,B140,B25,B51,B52,B72,B80,B81,B82,B9,C7,D9
`Chr3:18074058`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	111	A1,A10,A13,A18,A19,A2,A21,A22,A25,A6,A7,A9,B10,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B111,B114,B115,B117,B12,B120,B123,B126,B128,B129,B134,B135,B136,B137,B138,B140,B15,B19,B20,B24,B28,B3,B32,B37,B38,B40,B41,B42,B44,B45,B48,B5,B52,B53,B54,B55,B6,B61,B65,B66,B68,B73,B75,B76,B77,B81,B83,B84,B89,B9,B98,C1,C11,C19,C20,C22,C23,C24,C27,C3,C35,C36,C38,C40,C42,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C55,C63,C67,C7,C71,C73,C75,C79,C8,C83,C86,C9,D1,D2,D6,D9
`Chr3:18074110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr3:18074112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B56,B79,C54,C71
`Chr3:18074121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B11,B119,B41,B86
`Chr3:18074243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,C33,C35
`Chr3:18074251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B72,C29
`Chr3:18074261`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	C19,C55,C64,C66,C83,C87
`Chr3:18074268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B32,C32,C60
`Chr3:18074275`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B114,B120,B32,B33,B81,B88,C43,C63
`Chr3:18074277`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B114,B120,B32,B33,B81,B88,C43,C63
`Chr3:18074285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B38,C33,C35

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

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cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947203.1
ATGCCGTTTCCCCAGCGTCACTATAAGATCGTCGATTTTCCGAGTGGGACTACACAAGAAGGGGCCAAGACGGCAGAGTATGAGAGTGCACCGCCGATTGAGGAAAAAGCTGAGGAGAAAGAGAGGATGAAAGAGCGGCTCTCTAAGTTTTTAGAGATCTTTAAGAAGGTGAACATCAACATTTCGTTGGTGGAGATGTTACTAGAGATGCTGCAATATGCCAAATTCCTCAAGGACATAGTCTCGCAAAAGAAGAAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018487
ATGCCGTTTCCCCAGCGTCACTATAAGATCGTCGATTTTCCGAGTGGGACTACACAAGAAGGGGCCAAGACGGCAGAGTATGAGAGTGCACCGCCGATTGAGGAAAAAGCTGAGGAGAAAGAGAGGATGAAAGAGCGGCTCTCTAAGTTTTTAGAGATCTTTAAGAAGGTGAACATCAACATTTCGTTGGTGGAGATGTTACTAGAGATGCTGCAATATGCCAAATTCCTCAAGGACATAGTCTCGCAAAAGAAGAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803186.1
MPFPQRHYKIVDFPSGTTQEGAKTAEYESAPPIEEKAEEKERMKERLSKFLEIFKKVNINISLVEMLLEMLQYAKFLKDIVSQKKKLGKFETVRLNEECSAILQRKLSAKVKDPGSFTLFCIIGGQHFGRSLCDLGASINLMPLSIFQQLAIGELKPTYMRLQMAGRSITYPRGIVENVLVKVEDFIFPADFVVLDIEDDNKISLILGRPFLATGRALIDVEKGELTLRVHDESQTFFAYKPCHIRKDEVSKKAKDLGKD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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