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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001537`

染色体: Chr03 坐标: 19275888-19279780 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001537`
名称	SmilChr03G001537
描述	F-box protein CPR1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	19275888 - 19279780 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018497`
GeneID	`131018497`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018497`
原始查询	`LOC131018497`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein CPR1-like
产物	F-box protein CPR1-like
Arabidopsis	`AT3G06240` (AT3G06240) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819798] identity=27.1; qcov=0.9; evalue=1.12e-08; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018497

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057803197.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803197.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803197.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057803197.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803197.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:19275928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,B59,B98
`Chr3:19275964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:19276013`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A10,A20,B138,B48,B91,C1,C39,C46,C52,C79
`Chr3:19276083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:19276089`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B75
`Chr3:19276089`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B75
`Chr3:19276171`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	89	A19,A2,A21,A23,A25,A3,A5,A8,B101,B107,B109,B11,B113,B114,B119,B120,B121,B122,B124,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B135,B139,B14,B15,B16,B17,B18,B25,B26,B29,B31,B35,B37,B38,B39,B49,B5,B54,B6,B62,B65,B66,B68,B70,B72,B73,B75,B76,B79,B81,B82,B84,B87,B88,B90,B91,B92,C13,C20,C22,C25,C27,C28,C29,C34,C37,C39,C40,C43,C48,C50,C51,C62,C67,C74,C77,C78,C79,C82,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr3:19276177`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	89	A19,A2,A21,A23,A25,A3,A5,A8,B101,B107,B109,B11,B113,B114,B119,B120,B121,B122,B124,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B135,B139,B14,B15,B16,B17,B18,B25,B26,B29,B31,B35,B37,B38,B39,B49,B5,B54,B6,B62,B65,B66,B68,B70,B72,B73,B75,B76,B79,B81,B82,B84,B87,B88,B90,B91,B92,C13,C20,C22,C25,C27,C28,C29,C34,C37,C39,C40,C43,C48,C50,C51,C62,C67,C74,C77,C78,C79,C82,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr3:19276220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B13,C58
`Chr3:19276236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:19276244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B125,B51,B59,C15
`Chr3:19276244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B51,B59,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803197.1

221 aa

110

221

FBA_1

FBA_3

PF07734 FBA_1 40-217 aa PF08268 FBA_3 45-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803197.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	40	217	3.3e-12	46.8	F-box associated beta propeller domain
`XP_057803197.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	45	140	9.6e-10	38.7	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947214.1
ATGGGCAAAGCGAGGAAGGAGGCATATGAACAGCTAGGTAATATCCAAGGCTTGTCGATGGACGAAAAAATTAACCTCTGGTGGGTTTATATGAATGCAGTGGACATCAAATGGGTTGGTCAAGTCTATAGTTCGAAGACAAAATCATGGAAAACAATTGAGCATTGCGCGGATTTACTTTTCTGTGGCAGAGAGGGGGTGTTTGCAGGTGGGAAGCTTTACTGGACGAGTTTTAATGGACATAAAGAAGATATTATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018497
ATGGGCAAAGCGAGGAAGGAGGCATATGAACAGCTAGGTAATATCCAAGGCTTGTCGATGGACGAAAAAATTAACCTCTGGTGGGTTTATATGAATGCAGTGGACATCAAATGGGTTGGTCAAGTCTATAGTTCGAAGACAAAATCATGGAAAACAATTGAGCATTGCGCGGATTTACTTTTCTGTGGCAGAGAGGGGGTGTTTGCAGGTGGGAAGCTTTACTGGACGAGTTTTAATGGACATAAAGAAGATATTATTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803197.1
MGKARKEAYEQLGNIQGLSMDEKINLWWVYMNAVDIKWVGQVYSSKTKSWKTIEHCADLLFCGREGVFAGGKLYWTSFNGHKEDIIFFDLKSEVFGRIELPFDQEKYGFCSVGSIGGFLCVLSCNYERGVRVWVMESWEKVVTLDRLLELLQPPPLLVGVKGEILVNCGSTVLVYECQDNVVRSLKYCSCCWNSVFTKLDDCVRSISERVYVESLVSPQDL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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