当前解析结果
SmilChr03G001558| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001558 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001558 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001558 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 19644373 - 19654159 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018500 |
|---|---|
| GeneID | 131018500 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018500 |
| 原始查询 | LOC131018500 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018500 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803201.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057803201.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803201.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803201.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803201.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:19644935 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B38,B39 |
Chr3:19646348 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B107 |
Chr3:19646359 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B107,B140 |
Chr3:19646369 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B5,B57 |
Chr3:19646408 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B5,B57,C82 |
Chr3:19646423 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 17 | A20,B118,B121,B136,B140,B31,B36,B44,B54,B85,B90,C13,C15,C5,C51,C61,C84 |
Chr3:19646841 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C83 |
Chr3:19646854 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 6 | B38,B39,B91,C39,D6,D7 |
Chr3:19646883 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B15,B22,C82 |
Chr3:19646915 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B38,B39,D1 |
Chr3:19646932 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 64 | A14,A15,A19,A2,A20,A25,A4,A6,A7,B10,B102,B103,B105,B111,B113,B115,B122,B130,B138,B139,B14,B16,B18,B20,B39,B43,B50,B52,B58,B59,B61,B62,B64,B69,B7,B75,B79,B80,B81,B86,B90,B93,B94,B96,C12,C16,C21,C26,C32,C35,C36,C39,C43,C46,C52,C54,C65,C68,C73,C78,C79,C85,D10,D7 |
Chr3:19646935 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B117,B122,C22 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。