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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001568`

染色体: Chr03 坐标: 19811092-19811430 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001568`
名称	SmilChr03G001568
描述	uncharacterized SmilChr03G001568
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	19811092 - 19811430 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018502`
GeneID	`131018502`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018502`
原始查询	`LOC131018502`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF31073 (DUF8803)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018502

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803204.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057803204.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803204.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803204.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803204.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:19811095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,B80,C54
`Chr3:19811122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,C14,C72
`Chr3:19811125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B1,C1,C14,C43
`Chr3:19811139`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B59
`Chr3:19811139`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B59
`Chr3:19811143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B36,B59,B79
`Chr3:19811164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C54
`Chr3:19811213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B80,C16,C7,C79
`Chr3:19811247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B134,B53,C25
`Chr3:19811260`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B46
`Chr3:19811260`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B46
`Chr3:19811280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B60,B91,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803204.1

112 aa

112

DUF8803

PF31073 DUF8803 36-96 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803204.1`	Pfam	`PF31073`	DUF8803	Domain	36	96	5.3e-09	36.5	Domain of unknown function (DUF8803)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947221.1
ATGCTGACGGAGTTAGATGAGTGGAGGAATGAAGCTTACGAGAGTTCCCGGATCTACAAGGAAAGGGCGAAGAAGTTCCATGATTTGAACATTCGCACAAAGGAATTCAAGCCGGGACATGAGGTACTCTTGTATGATTCTAAGCTTCGTCTATTTCCTGGCAAGCTGCAGTCTAGATGGAGAGGTCCTTACGTGGTTCACAAGAGCAATTGGAATGGGACCTATGAGTTGCTTGCGTCGAATGGGTCTACTTTCACTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018502
ATGCTGACGGAGTTAGATGAGTGGAGGAATGAAGCTTACGAGAGTTCCCGGATCTACAAGGAAAGGGCGAAGAAGTTCCATGATTTGAACATTCGCACAAAGGAATTCAAGCCGGGACATGAGGTACTCTTGTATGATTCTAAGCTTCGTCTATTTCCTGGCAAGCTGCAGTCTAGATGGAGAGGTCCTTACGTGGTTCACAAGAGCAATTGGAATGGGACCTATGAGTTGCTTGCGTCGAATGGGTCTACTTTCACTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803204.1
MLTELDEWRNEAYESSRIYKERAKKFHDLNIRTKEFKPGHEVLLYDSKLRLFPGKLQSRWRGPYVVHKSNWNGTYELLASNGSTFTVNGHRLKPYFKAELDRDVEVVNFVDP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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