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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001593`

染色体: Chr03 坐标: 20191125-20194405 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001593`
名称	SmilChr03G001593
描述	uncharacterized SmilChr03G001593
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	20191125 - 20194405 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018509`
GeneID	`131018509`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018509`
原始查询	`LOC131018509`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0307600; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os11g0307600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0307600` - identity=19.2; qcov=0.553; evalue=1.41e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018509

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803209.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803209.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803209.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803209.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803209.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:20191975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,B6
`Chr3:20191981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr3:20191983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr3:20191993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B3,B44,B80
`Chr3:20191994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr3:20192168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B52
`Chr3:20192972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B18,B94,C75,C85
`Chr3:20193114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A3
`Chr3:20193117`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B139,B4,B87,C72,C85
`Chr3:20193117`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B139,B4,B87,C72,C85
`Chr3:20193122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,C18,C28,C49
`Chr3:20193151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A14,B27,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803209.1

349 aa

174

349

DUF8566

PF29561 DUF8566 161-345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803209.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	161	345	1.7e-43	149.5	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947226.1
ATGACGTCGGAGGGGAATGTTACTACAAAGGACAAAGGGAAAAATATAATTGAAGGTTCGGTATTCGGCGAGGGTAGTCGTATTGCAAACAGAGGGAAGAGTAAGAACAAAGTGCAGGGGAAAGGTGTGACTGATACATCTGATTTTGTGGAGAATAGTCCTCGAGTAACTAGAGGTAGCGTAAAGGGAAAGGCCAAACTGAATGAAGGTGTTGCACAACTGAATGAAGTTCGTACGAAGTATCGGAATGATCCAACATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018509
ATGACGTCGGAGGGGAATGTTACTACAAAGGACAAAGGGAAAAATATAATTGAAGGTTCGGTATTCGGCGAGGGTAGTCGTATTGCAAACAGAGGGAAGAGTAAGAACAAAGTGCAGGGGAAAGGTGTGACTGATACATCTGATTTTGTGGAGAATAGTCCTCGAGTAACTAGAGGTAGCGTAAAGGGAAAGGCCAAACTGAATGAAGGTGTTGCACAACTGAATGAAGTTCGTACGAAGTATCGGAATGATCCAACATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803209.1
MTSEGNVTTKDKGKNIIEGSVFGEGSRIANRGKSKNKVQGKGVTDTSDFVENSPRVTRGSVKGKAKLNEGVAQLNEVRTKYRNDPTLLAFKRSLLGGKILKRKLSETSGKDVTGSSVVPSIRVVPPVAPAKRTRIDKRKLDVENYTKLEVKKYDDYPSLYIRSTPCVLLKVVNEMNDVQKQVVKSLGFGHVLNLTIQEMPSKLDYWVLDHFHARRSEIMFPCGKSIEVIEEDAYRMLGFPRGGRPVDLLEKYETTDLYDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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