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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001621`

染色体: Chr03 坐标: 20776699-20778510 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001621`
名称	SmilChr03G001621
描述	uncharacterized SmilChr03G001621
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	20776699 - 20778510 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018518`
GeneID	`131018518`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018518`
原始查询	`LOC131018518`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G51080` (AT5G51080) RNase H family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835181] identity=29.9; qcov=0.178; evalue=9.85e-06; confidence=weak
Rice	`Os04g0191000` - identity=23.2; qcov=0.694; evalue=8.06e-11; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF17921 (Integrase_H2C2); PF31073 (DUF8803)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018518

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803219.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057803219.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803219.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803219.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803219.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:20776717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C34,C67
`Chr3:20776764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,C34,C67
`Chr3:20776774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B56,B65,B96,C27,C9
`Chr3:20776791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr3:20776798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B9
`Chr3:20776804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,C66,C82
`Chr3:20776810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C85
`Chr3:20776818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B39,C38
`Chr3:20776825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,C65,D10
`Chr3:20776838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B39,B4
`Chr3:20776842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,C25,C67
`Chr3:20776851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803219.1

490 aa

245

490

RVT_3

Integrase_H2C2

DUF8803

PF13456 RVT_3 47-165 aa PF17921 Integrase_H2C2 230-269 aa PF31073 DUF8803 429-489 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803219.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	47	165	4e-15	56.5	Reverse transcriptase-like
`XP_057803219.1`	Pfam	`PF17921`	Integrase_H2C2	Domain	230	269	7.5e-07	29.9	Integrase zinc binding domain
`XP_057803219.1`	Pfam	`PF31073`	DUF8803	Domain	429	489	7.2e-24	84.1	Domain of unknown function (DUF8803)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947236.1
ATGGTCAAGTGGGCCGTGGAGTTAGGGGAGTACGATGTGGAGTATGAGCCGATAACGGCAATCAAAGCACAAGCTCTGGCGGATTTCATCCAAGAAACCACTCGCCGACCTATGCAAGAATTTTGGGTCGCCTTTGTTGATGGGTCGGTTACCAAAGAAGGGTGCGGAATTGGGGTGTACATCATCTCGCCAGGATATGGGATATATCAATTTGCTATCAAATTCACCTGCCAGATGTCCAACAACGAGGCCGAGTACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018518
ATGGTCAAGTGGGCCGTGGAGTTAGGGGAGTACGATGTGGAGTATGAGCCGATAACGGCAATCAAAGCACAAGCTCTGGCGGATTTCATCCAAGAAACCACTCGCCGACCTATGCAAGAATTTTGGGTCGCCTTTGTTGATGGGTCGGTTACCAAAGAAGGGTGCGGAATTGGGGTGTACATCATCTCGCCAGGATATGGGATATATCAATTTGCTATCAAATTCACCTGCCAGATGTCCAACAACGAGGCCGAGTACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803219.1
MVKWAVELGEYDVEYEPITAIKAQALADFIQETTRRPMQEFWVAFVDGSVTKEGCGIGVYIISPGYGIYQFAIKFTCQMSNNEAEYEAVVRGEHILSELKAECVIIRTDSQLVAQQLSGAYHVKDQRMKAYHCKISDMKQKFMEFKIEQISREENTKADLLARMASVVEQTWNEEIILLCDTREMGTSQVISVEIRDDWRAPIIHFLKTGERLSRESDQRARYENYCCYGGHTGFQVLVCKIIRAGFYWPNINKGAREFI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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