当前解析结果
SmilChr03G001703| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001703 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001703 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001703 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 22629107 - 22629454 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018539 |
|---|---|
| GeneID | 131018539 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018539 |
| 原始查询 | LOC131018539 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018539 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803239.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057803239.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803239.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803239.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803239.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:22629118 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C43,C56 |
Chr3:22629119 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B136,C20 |
Chr3:22629122 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B54,B81 |
Chr3:22629127 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B112,B45,C36,C59,D8 |
Chr3:22629130 |
C |
CAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | A5 |
Chr3:22629130 |
C |
CAA |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | A5 |
Chr3:22629139 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B27,B71,C72 |
Chr3:22629142 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B132,B94,D10 |
Chr3:22629145 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B82 |
Chr3:22629153 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B13,B131 |
Chr3:22629166 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A5,B40,B98,C27,D4 |
Chr3:22629178 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C36 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。