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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001783`

染色体: Chr03 坐标: 24388463-24391207 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001783`
名称	SmilChr03G001783
描述	uncharacterized SmilChr03G001783
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	24388463 - 24391207 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018562`
GeneID	`131018562`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018562`
原始查询	`LOC131018562`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0439900` - identity=35; qcov=0.275; evalue=1.66e-27; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018562

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803260.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057803260.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057803260.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803260.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057803260.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:24388468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr3:24388478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr3:24388483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B60
`Chr3:24388498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr3:24388505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B104,B56,B96,C54
`Chr3:24388511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,B59
`Chr3:24388512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B51,C73,D1
`Chr3:24388520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C8
`Chr3:24388530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C6
`Chr3:24388532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B74
`Chr3:24388549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	28	A2,A5,A7,B105,B121,B134,B15,B16,B2,B50,B55,B56,B59,B64,B67,B7,B89,B91,B96,C17,C24,C29,C3,C33,C43,C60,D3,D8
`Chr3:24388552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B140,B48,C54,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803260.1

873 aa

436

873

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 289-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803260.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	289	354	4.4e-11	43.7	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947277.1
ATGGGATCCTCTGATGCTCACCGCAACTTGGAGAAGGAGTTCGATTCTGCTGCTGTCACTACCGAGGTGCCTACCTCACTGTTCAATGGCCCTCAGGGTAACCCCACTTTCACTGTGCCACCGGGTTTTCAGGCTATCTCAGCCACTCCGACAACAGGGTTGAATGTCAACGCCCAGAGGTTTGCTCTGGTAACACCGGGCTCTGATCTGCCAAGTCTGGCCCCCACATCTGGAGGGGGATCGCTTAACTTTGGGCTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018562
ATGGGATCCTCTGATGCTCACCGCAACTTGGAGAAGGAGTTCGATTCTGCTGCTGTCACTACCGAGGTGCCTACCTCACTGTTCAATGGCCCTCAGGGTAACCCCACTTTCACTGTGCCACCGGGTTTTCAGGCTATCTCAGCCACTCCGACAACAGGGTTGAATGTCAACGCCCAGAGGTTTGCTCTGGTAACACCGGGCTCTGATCTGCCAAGTCTGGCCCCCACATCTGGAGGGGGATCGCTTAACTTTGGGCTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803260.1
MGSSDAHRNLEKEFDSAAVTTEVPTSLFNGPQGNPTFTVPPGFQAISATPTTGLNVNAQRFALVTPGSDLPSLAPTSGGGSLNFGLAEQMMALLSYANMRQALGTLMMSVIPTVATPAVMPGEMQGDAADRELARPEGSRVRLNSVVRKEREERPKEKARLKKQVSQLKHQLENLEESLREKSRRDDREQRSERSYRVEKSKSHRPEKSRYTERSEERELEFFSGRPGHRAHKRHDRDVPRDRREQGRYKEDKRAKTSRF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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