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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001822`

染色体: Chr03 坐标: 24937182-24938090 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001822`
名称	SmilChr03G001822
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	24937182 - 24938090 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018572`
GeneID	`131018572`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018572`
原始查询	`LOC131018572`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G23160` (CRK8) cysteine-rich RECEPTOR-like kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828415] identity=35.1; qcov=0.831; evalue=1.88e-45; confidence=medium
Rice	`Os08g0125300` - identity=37.6; qcov=0.934; evalue=1.01e-59; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07727 (RVT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018572

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803270.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803270.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803270.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803270.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803270.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:24937200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,B69,B81
`Chr3:24937236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B74,B90
`Chr3:24937287`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B103,B30,B36,B54,B86,C17,C30,C35,C5,C7,C75,C76
`Chr3:24937292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B90
`Chr3:24937299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B117,B131,B133,B72,C11
`Chr3:24937299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B131,B133,B72,C11
`Chr3:24937303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B134,B72,C2,C60
`Chr3:24937312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B101,B39,C13
`Chr3:24937331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B39
`Chr3:24937346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B133,B72
`Chr3:24937381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A8,B126,B15,B68,B94,C13,C16,C25,C3,C42,C48,C83
`Chr3:24937401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803270.1

302 aa

151

302

RVT_2

PF07727 RVT_2 2-64 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803270.1`	Pfam	`PF07727`	RVT_2	Domain	2	64	1.1e-09	39.0	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947287.1
ATGTGCAAGAAGTTTGATGAGATTATGACGAGTAAATTCCAGATGTCAATGATGGGAGAAATGAATTTCTTTCTGGGATTACAAGTCAAGCAAACCAAGGAAGGCATACTGATCAATCAGTCAAAGTATGCTAAGGAATTGATTAACAAGTTCGGTGTTCAACACATGAAGACTGTGAAGATTCCCATGATCATTAACTGGAAAGTTAACCCAGAGAAAGTGAGAAAATCAGTCTCTTCAACGAAGTACAGAAAAATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018572
ATGTGCAAGAAGTTTGATGAGATTATGACGAGTAAATTCCAGATGTCAATGATGGGAGAAATGAATTTCTTTCTGGGATTACAAGTCAAGCAAACCAAGGAAGGCATACTGATCAATCAGTCAAAGTATGCTAAGGAATTGATTAACAAGTTCGGTGTTCAACACATGAAGACTGTGAAGATTCCCATGATCATTAACTGGAAAGTTAACCCAGAGAAAGTGAGAAAATCAGTCTCTTCAACGAAGTACAGAAAAATCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803270.1
MCKKFDEIMTSKFQMSMMGEMNFFLGLQVKQTKEGILINQSKYAKELINKFGVQHMKTVKIPMIINWKVNPEKVRKSVSSTKYRKIIGSLLYLTASRPDIAFAVGVCARFQSDPKDAHMDAAKYILRYIKGTPNVGLWYPVDDNFKLLGYTNSDFAGCAIDRESTSDTCQFLGNKLISWFSKKQTFVATSTTEAEYVVTGSCCLQILWLVQQLKDYGIKEREVPIYCDSSSAIAISQNHVHHTRIKHVAICHHFIRDHVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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