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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001834`

染色体: Chr03 坐标: 25176699-25177767 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001834`
名称	SmilChr03G001834
描述	uncharacterized SmilChr03G001834
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	25176699 - 25177767 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018575`
GeneID	`131018575`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018575`
原始查询	`LOC131018575`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G15685` (AT5G15685) mutator transposase MUDRA protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28721163] identity=23.4; qcov=1.03; evalue=2.01e-20; confidence=weak
Rice	`Os06g0704400` - identity=29.2; qcov=0.926; evalue=2.08e-24; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018575

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803272.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803272.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803272.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803272.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803272.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:25176698`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B124,B32,B49,B64,B79,C24,C42,C6
`Chr3:25176915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr3:25176937`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	80	A10,A13,A14,A16,A18,A2,A23,A25,A7,B1,B104,B106,B108,B111,B118,B121,B123,B130,B131,B133,B138,B140,B17,B24,B3,B32,B34,B35,B38,B39,B42,B43,B46,B47,B48,B52,B53,B61,B63,B65,B66,B68,B69,B73,B75,B76,B77,B81,B83,B84,B86,B9,B90,B92,C1,C11,C16,C23,C29,C36,C37,C41,C48,C51,C53,C54,C56,C58,C59,C6,C62,C65,C69,C8,C80,C81,C84,C9,D2,D5
`Chr3:25176961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A19,B137
`Chr3:25176961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B137
`Chr3:25176973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B25,B88
`Chr3:25177205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr3:25177208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C3
`Chr3:25177226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B105,B110,B115,C3
`Chr3:25177237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,B5
`Chr3:25177241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:25177251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A5,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947289.1
ATGGGTTTAGAGAAAGAGAATGAAGAAGAAAGATTGTCTGAATATGATGATTCTGACAAAGAGAGGTCTGATAGTGGTGACTCAGATGATTTGAAGCTTATTCTAGGCATGCGGTTTGAGGATGTTTTTCAGTGCAAGAAAGCACTGGTATCATGGAGCATAGTTAAAGGTCATCCAATTCACTTTAGAAGGGTAAGCAAGGATCAGTATGAGGCTTATTGTGAGGAGCCTTATCAGTGGAGAATCTATGCTAGTATAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018575
ATGGGTTTAGAGAAAGAGAATGAAGAAGAAAGATTGTCTGAATATGATGATTCTGACAAAGAGAGGTCTGATAGTGGTGACTCAGATGATTTGAAGCTTATTCTAGGCATGCGGTTTGAGGATGTTTTTCAGTGCAAGAAAGCACTGGTATCATGGAGCATAGTTAAAGGTCATCCAATTCACTTTAGAAGGGTAAGCAAGGATCAGTATGAGGCTTATTGTGAGGAGCCTTATCAGTGGAGAATCTATGCTAGTATAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803272.1
MGLEKENEEERLSEYDDSDKERSDSGDSDDLKLILGMRFEDVFQCKKALVSWSIVKGHPIHFRRVSKDQYEAYCEEPYQWRIYASIKKNERYLVVKILGQDHTCAFAIGNKQARYKWLGEEYTEVFRVRPQMCVEDFRNDVKRRFNIAVPNGRLYRAKAHALQVLRGTVQGYYNKLRSYIAELMRVDREGGFELLCGDGCQLLCAIGKDGNNQMYPIAWAVVEVENEACWRWFLSLLLEELGIRDENGFTLISDQQKNSC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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