当前解析结果
SmilChr03G001848| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001848 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001848 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001848 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 25414179 - 25415719 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018580 |
|---|---|
| GeneID | 131018580 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018580 |
| 原始查询 | LOC131018580 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018580 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057803276.1 |
| 2 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.60000 | XP_057803276.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057803276.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.40000 | XP_057803276.1 |
| 5 | P-body | P-body | 0.20000 | XP_057803276.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:25414740 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B41,C21 |
Chr3:25414769 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A1,B53 |
Chr3:25414807 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B65,C23,C34,C83 |
Chr3:25415069 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B120,B90,C29,C48 |
Chr3:25415090 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr3:25415154 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr3:25415384 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr3:25415478 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B138,B92,C41,C44,C87 |
Chr3:25415502 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B138,B92,C41,C44,C87,D9 |
Chr3:25415716 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B75,B78,C82 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。