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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001873`

染色体: Chr03 坐标: 25977273-25978713 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001873`
名称	SmilChr03G001873
描述	uncharacterized SmilChr03G001873
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	25977273 - 25978713 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018588`
GeneID	`131018588`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018588`
原始查询	`LOC131018588`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=37.7; qcov=0.475; evalue=5.06e-44; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018588

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803284.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057803284.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803284.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803284.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803284.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:25977295`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B63
`Chr3:25977295`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B63
`Chr3:25977301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr3:25977323`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A4,B100,B121,B125,B133,B134,B5,B67,B71,B77,C62,C86,C87
`Chr3:25977327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A4,B100,B121,B125,B133,B134,B5,B67,B71,B77,C62,C86,C87
`Chr3:25977363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B136,B17,B52,B73,C47,C54
`Chr3:25977385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B33,B53,B9,C57
`Chr3:25977388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C73
`Chr3:25977393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B91,C57
`Chr3:25977399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:25977411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:25977423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B1,B121,B133,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803284.1

453 aa

226

453

DUF7769

PF24964 DUF7769 10-63 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803284.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	10	63	2.7e-11	43.7	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947301.1
ATGCCAAATCGCTGGAGGCCAGATTTTACAAAAGAAGAAAAAGAGAAGGTTCTTCAATTTCTGCTACAACACTCCAAAGATGGAGTTCTTCAAAGAGGGACACCAAAAGAGGCAGCTGCAGTGTTGGGAGTTTCAGTGCGGTCAGTACGACAAATATGGACAACTGCAAGCCAACAATTAAAGAATGGTGAAGTTGTGCATTTTCAAAATAGAAGAAAAGGTGTGCAACATTTTGACAAGATGAAGCCTAATGAAGACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018588
ATGCCAAATCGCTGGAGGCCAGATTTTACAAAAGAAGAAAAAGAGAAGGTTCTTCAATTTCTGCTACAACACTCCAAAGATGGAGTTCTTCAAAGAGGGACACCAAAAGAGGCAGCTGCAGTGTTGGGAGTTTCAGTGCGGTCAGTACGACAAATATGGACAACTGCAAGCCAACAATTAAAGAATGGTGAAGTTGTGCATTTTCAAAATAGAAGAAAAGGTGTGCAACATTTTGACAAGATGAAGCCTAATGAAGACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803284.1
MPNRWRPDFTKEEKEKVLQFLLQHSKDGVLQRGTPKEAAAVLGVSVRSVRQIWTTASQQLKNGEVVHFQNRRKGVQHFDKMKPNEDNIRALPVKDRGTIRRMASKLGISKSLVGEWIKDKQLGAHTSAVKPLLTEENKLARLKFSLSQLNSAANIDGKFTFKGMHNVVHIDEKWFYMSNVAERYYLLPHEEDPYRTCKSKRFIQKIMFLCAVTRPIFNETGEMIFDGKIGIFPFTEVVPAQRNSKNRVRGTMETKPIQSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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