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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001879`

染色体: Chr03 坐标: 26080846-26082531 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001879`
名称	SmilChr03G001879
描述	uncharacterized SmilChr03G001879
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	26080846 - 26082531 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018590`
GeneID	`131018590`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018590`
原始查询	`LOC131018590`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=36.7; qcov=0.4; evalue=6.47e-25; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018590

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803286.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057803286.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057803286.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803286.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803286.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:26080851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B36,C12
`Chr3:26080884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,C1,D3
`Chr3:26080957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C21
`Chr3:26080976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,B71
`Chr3:26081028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	76	A1,A13,A14,A15,A16,A2,A23,A25,A3,A4,B1,B100,B103,B11,B113,B117,B118,B122,B124,B13,B134,B2,B26,B29,B3,B32,B35,B40,B47,B5,B50,B53,B55,B56,B6,B61,B62,B63,B66,B67,B68,B71,B72,B78,B8,B89,B93,B94,B95,B96,B98,C1,C14,C18,C2,C22,C23,C25,C27,C30,C32,C36,C5,C50,C51,C55,C61,C68,C72,C76,C82,C84,D1,D3,D5,D9
`Chr3:26081054`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C11,C69
`Chr3:26081054`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr3:26081057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B66,B68
`Chr3:26081058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,D3
`Chr3:26081074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B1,B2,C62,C78
`Chr3:26081099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,D11
`Chr3:26081108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803286.1

423 aa

212

423

DUF7769

PF24964 DUF7769 6-60 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803286.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	6	60	2.6e-10	40.5	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947303.1
ATGCGGCGCAAGGATCTAACAACGGGAGAGAGAAACTCTGTAGTGCAGTTTTTGCTTGAAGATAGCCAAGGTGGGAAGCCAAAAAGGGGCAGAATGCAGGCTGCCGCCGTCAAGTTTGCCGTCTGCCGTCGAACGGTAAATCGTTTATGGACTGCTGCAAAAAAACAGCAAGCACAAGGTCAGTATATTCATAGTAGCAGTGGCAAAATCAACAAGTCAAGGCGCAAGAGAGTTGAAATAGATCTTCAATTAATTTCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018590
ATGCGGCGCAAGGATCTAACAACGGGAGAGAGAAACTCTGTAGTGCAGTTTTTGCTTGAAGATAGCCAAGGTGGGAAGCCAAAAAGGGGCAGAATGCAGGCTGCCGCCGTCAAGTTTGCCGTCTGCCGTCGAACGGTAAATCGTTTATGGACTGCTGCAAAAAAACAGCAAGCACAAGGTCAGTATATTCATAGTAGCAGTGGCAAAATCAACAAGTCAAGGCGCAAGAGAGTTGAAATAGATCTTCAATTAATTTCAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803286.1
MRRKDLTTGERNSVVQFLLEDSQGGKPKRGRMQAAAVKFAVCRRTVNRLWTAAKKQQAQGQYIHSSSGKINKSRRKRVEIDLQLISTLELSKRSTIRRLASGISCSKSTVGRWISKGLIRAHTSAIKPDLTAPNKLLRLRFSLEAIEYDRILKVLQFKSMHNTVHIDEKWFYITKSNHRPLIAEDGTVLFDGKIGIFPFTEYVPAKRSSKNREAGTLEQKPIQSITKEIIPAIKAKWPQFASRVIFIQQDNAKPHIKDSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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